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辣椒不同发育时期果实的转录组分析
文献摘要：
[目的]广泛深入认识辣椒素生物合成的调控因素,为辣椒生物技术育种工作提供分子基础.[方法]对2个不同辣度的辣椒材料'754-3-1-1-1'和'渝椒5号'快速生长期(KS)和绿熟期(LS)的果实分别进行转录组测序,通过Cufflinks软件进行基因差异表达分析并利用荧光定量RT-PCR验证基因表达数据的准确性,比较2个材料2个发育时期的转录组数据获得差异表达基因,并对差异表达基因进行 GO功能富集分析.[结果]L754LS_vs_L754KS、YJ5LS_vs_YJ5KS、L754KS_vs_YJ5KS 和 L754LS_vs_YJ5LS 4组对比分别有139、1903、5550和3220个差异表达基因.2个材料在KS期有2667个(48％)特有的差异表达基因,在LS期有871个(27％)特有的差异表达基因.4组对比数据的差异表达基因中共鉴定到18个CapCyc模型基因,其中PAL、CCoAOMT和CCR 等辣椒素合成途径中的结构基因在不同样品中表达差异3倍以上.此外,还鉴定出可能参与调控辣椒素合成的36个MYB家族转录因子和4个ERF转录因子.[结论]辣椒素含量受果实发育早期基因的表达水平影响更大.PAL等结构基因可能具有调控辣椒素物质生物合成的作用.本研究为辣椒素生物合成的调控网络研究提供了更多的候选基因.
文献关键词：
辣椒;辣椒素类物质生物合成;调控;果实;转录因子;MYB;ERF
中图分类号：
作者姓名：
王红娟;唐荣莉;蒋晓英;官玲;雷开荣;黄启中;林清
作者机构：
重庆市农业科学院生物技术研究所,重庆 401329;重庆市农业科学院蔬菜花卉研究所,重庆 401329
文献出处：
引用格式：
[1]王红娟;唐荣莉;蒋晓英;官玲;雷开荣;黄启中;林清-.辣椒不同发育时期果实的转录组分析)[J].西南农业学报,2022(03):517-525
A类：
Cufflinks,L754LS,L754KS,YJ5LS,YJ5KS,CapCyc,辣椒素类物质生物合成
B类：
不同发育时期,转录组分析,调控因素,生物技术育种,育种工作,分子基础,快速生长期,熟期,转录组测序,基因差异表达,差异表达分析,基因表达数据,转录组数据,差异表达基因,功能富集分析,对比数据,PAL,CCoAOMT,CCR,合成途径,结构基因,表达差异,MYB,ERF,果实发育,早期基因,调控网络,候选基因
AB值：
0.231434
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