典型文献
紫鸭跖草根组织应答铜胁迫的转录组分析
文献摘要：
紫鸭跖草是一种高耐铜的超积累植物,本研究首次应用RNA-Seq技术对其转录组进行分析.通过全长转录组分析组装了紫鸭跖草耐铜相关候选基因,通过转录组分析,共获得82471条N50长度为2299 bp的高质量unigene,为紫鸭跖草的进一步研究提供了丰富的数据.对照组(CK)、300μmol/L胁迫组(CT1)和1000μmol/L胁迫组(CT2)的测序数据已保存在NCBI的SRA数据库中,登录号为SAMN11265427.CT1相比于CK,共有5028条unigene在根组织中有显著性差异表达,约占全部unigene的6.10％,其中富集上调和下调的基因分别为3138和1890条;CT2相比于CT1,根中共有6813个unigene富集差异表达,占所有unigene的8.26％.其中富集上调和下调的基因分别为2555和4258.随机选取10个基因进行qRT-PCR荧光定量分析,结果与Illumina测序数据一致,验证了基因数据差异表达的有效性.上述实验从分子水平上为研究铜胁迫下铜耐受的分子机制提供了理论依据.
文献关键词：
紫鸭跖草;根组织;铜胁迫;转录组
中图分类号：
作者姓名：
彭国颖;胡亮;黄超;杨坤;万玮;黄长干
作者机构：
江西农业大学 南昌市植物资源化学利用重点实验室,南昌 330045;江西农业大学校友办,南昌 330045
文献出处：
引用格式：
[1]彭国颖;胡亮;黄超;杨坤;万玮;黄长干-.紫鸭跖草根组织应答铜胁迫的转录组分析)[J].生物技术通报,2022(02):83-94
A类：
SAMN11265427
B类：
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AB值：
0.289515
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