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典型文献
谷子几丁质酶基因家族鉴定及在白发病菌胁迫下的表达分析
文献摘要:
谷子白发病是威胁谷子产量和品质的重要系统性侵染病害.在抵抗病原菌的过程中,抗病相关基因起着尤为重要的作用.几丁质酶(Chitinase,EC.3.2.1.14)是植物抗病反应过程中的一类重要的病程相关蛋白,在植物防御病原菌侵染和害虫危害中扮演重要的角色.本研究在前期对白发病菌侵染抗感谷子品种转录组分析的基础上发现几丁质酶家族基因在抗感品种中显著差异表达,推测该家族基因可能参与谷子对白发病的抗病反应过程.基于此,本研究运用生物信息学相关技术对筛选出的30个谷子候选抗病相关几丁质酶家族基因进行染色体定位,利用TBtools等软件对该基因家族的理化性质、基因结构、发育树构建、蛋白序列及其转录水平进行分析.结果表明,30个谷子几丁质酶家族基因分布在8条染色体上(第6条染色体除外).几丁质酶蛋白均含有分泌信号肽,预测为分泌蛋白,且具有保守蛋白基序.系统发育树分析显示,该基因家族成员可分为3个亚组.结合白发病菌侵染抗感谷子转录组数据,根据其表达模式的差异,可分为上调、下调和不表达3类基因.荧光定量PCR结果表明,Seita.1G225300、Seita.4G286000、Seita.5G389900、Seita.7G150600、Seita.7G150700和Seita.8G076900这些基因表达在抗感品种中存在显著差异,很可能参与抗白发病的调控过程.其研究结果有望为谷子抗病基因克隆及分子育种提供一定的理论参考.
文献关键词:
谷子;白发病菌;几丁质酶;基因家族;抗病
作者姓名:
韩海丽;王鹤;董梦迪;马芳芳;韩渊怀;韩彦卿
作者机构:
山西农业大学 植物保护学院,太谷 030801;山西农业大学 创新创业学院,太谷 030801;山西农业大学 农学院,太谷 030801;杂粮种质创新与分子育种 山西省重点实验室,太原 030031
文献出处:
引用格式:
[1]韩海丽;王鹤;董梦迪;马芳芳;韩渊怀;韩彦卿-.谷子几丁质酶基因家族鉴定及在白发病菌胁迫下的表达分析)[J].激光生物学报,2022(04):368-378
A类:
白发病菌,侵染病害,1G225300,4G286000,5G389900,7G150600,7G150700,8G076900
B类:
几丁质酶基因,基因家族鉴定,胁迫,表达分析,谷子白发病,谷子产量,产量和品质,Chitinase,EC,植物抗病,抗病反应,反应过程,病程相关蛋白,植物防御,病原菌侵染,害虫危害,转录组分析,家族基因,差异表达,研究运用,染色体定位,TBtools,基因结构,转录水平,基因分布,除外,信号肽,分泌蛋白,基序,系统发育树分析,转录组数据,表达模式,Seita,抗病基因,基因克隆,分子育种
AB值:
0.223756
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