典型文献
我国猪瘟病毒2.1c亚型优势流行株的全基因组序列分析
文献摘要：
为了揭示我国猪瘟病毒2.1c流行株的基因组特征,对从1998年和2011-2018年收集的8个2.1c流行株进行全基因组序列测定和比较分析.结果表明:基因2.1c流行株之间的基因组序列同源性为96.3％～99.1％,多聚蛋白的氨基酸同源性为98.2％～99.3％,这些毒株与疫苗C株的基因组和多聚蛋白同源性分别为83.9％～84.7％和91.7％～92.4％.多聚蛋白氨基酸比对发现,2.1c流行株相比于疫苗株至少有260个氨基酸替换位点,其中Erns蛋白的替换比例最高,其次为NS5A,Core和E2.选择压力分析显示,猪瘟病毒2.1c流行株多聚蛋白的选择压力测度参数ω＜1,表明其正承受着纯化选择压力,同时发现14个正向选择位点分布于7个病毒蛋白上.基于E2基因的进化分析显示,2.1c流行株的E2基因平均进化速率为1.862×10-3个替换/位点/年,高于所有基因型毒株E2基因的进化速率(9.547×10-4个替换/位点/年).研究系统地分析了基因2.1c亚型流行株的进化特点及其与C株的遗传差异,结果有助于进一步研究猪瘟病毒的遗传衍化规律.
文献关键词：
猪瘟病毒;C株;2.1c亚型毒株;基因组序列分析
中图分类号：
作者姓名：
徐佳轮;邢超男;米士江;龚文杰;涂长春
作者机构：
吉林大学动物医学学院,长春130062;军事医学研究院军事兽医研究所,长春130122
文献出处：
引用格式：
[1]徐佳轮;邢超男;米士江;龚文杰;涂长春-.我国猪瘟病毒2.1c亚型优势流行株的全基因组序列分析)[J].吉林农业大学学报,2022(01):78-85
A类：
B类：
猪瘟病毒,1c,优势流,全基因组序列分析,基因组特征,序列测定,序列同源性,多聚,毒株,疫苗株,换位,Erns,NS5A,Core,E2,选择压力,压力分析,正向选择位点,病毒蛋白,进化分析,进化速率,基因型,研究系统,遗传差异,传衍,衍化
AB值：
0.25763
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