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肠道噬菌体组生物信息学分析方法的研究进展
文献摘要：
噬菌体是感染细菌的病毒,广泛存在于各类环境中.由于传统实验研究的局限性及噬菌体基因的特异性,导致对肠道噬菌体的研究很少.随着宏基因组测序技术的发展和各种生物信息分析软件的开发,可以通过噬菌体组学,加深对肠道噬菌体的认识.噬菌体组分析流程主要包括原始数据质量控制和预处理,病毒基因组序列的拼接组装,类病毒颗粒的筛选和系统分类注释以及进化分析和预测相应宿主细菌.本文对噬菌体组分析流程和其中所需要的常用生物信息分析工具和数据库进行详细的介绍,可以为肠道噬菌体研究以及相关的研究人员提供参考.
文献关键词：
肠道噬菌体;生物信息学;噬菌体组;病毒组;机器学习软件;数据库
中图分类号：
作者姓名：
胡晴玥;李德志;刘箐
作者机构：
上海理工大学 健康科学与工程学院,上海 200093
文献出处：
引用格式：
[1]胡晴玥;李德志;刘箐-.肠道噬菌体组生物信息学分析方法的研究进展)[J].微生物学杂志,2022(03):89-99
A类：
肠道噬菌体,噬菌体组,机器学习软件
B类：
生物信息学分析,传统实验,宏基因组测序技术,生物信息分析,原始数据,数据质量控制,病毒基因组,基因组序列,拼接,类病毒,病毒颗,系统分类,进化分析,宿主,病毒组
AB值：
0.160659
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