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玉米CHX基因家族全基因组鉴定与表达分析
文献摘要：
CHX(cation/H+exchanger)基因家族属于CPA2(cation proton antiporter 2)超家族的一员,蛋白序列的N端存在一个Na+/H+exchanger结构域.现有研究表明,植物CHX基因家族参与调控转运细胞质子和离子,在生长发育和胁迫应答中扮演重要角色.因此,研究从玉米CHX基因家族入手,首先通过全基因组水平筛选鉴定出16个玉米CHX基因.染色体定位分析表明ZmCHXs不均匀地分布在8条不同的染色体上;系统进化分析显示,16个ZmCHXs基因可分为3组,并且各组内蛋白序列和基因结构保守.组织表达特性分析发现ZmCHXs主要表达在花药中.进一步非生物胁迫表达分析结果表明,仅有GroupⅣ基因表达受冷及盐胁迫诱导.通过研究将为后续深入探究玉米CHX基因家族参与的非生物胁迫应答分子机制提供理论依据.
文献关键词：
玉米;CHX;非生物胁迫;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
贾博为;金军;庄齐;董伟峰;才晓溪;孙明哲;孙晓丽
作者机构：
黑龙江八一农垦大学农学院/作物逆境分子生物学实验室,大庆 163319
文献出处：
引用格式：
[1]贾博为;金军;庄齐;董伟峰;才晓溪;孙明哲;孙晓丽-.玉米CHX基因家族全基因组鉴定与表达分析)[J].黑龙江八一农垦大学学报,2022(04):23-30,64
A类：
CPA2,ZmCHXs
B类：
基因家族,全基因组鉴定,表达分析,cation,H+exchanger,族属,proton,antiporter,超家族,一员,Na+,结构域,家族参与,细胞质,质子,胁迫应答,筛选鉴定,染色体定位,定位分析,系统进化分析,基因结构,组织表达特性,花药,非生物胁迫,Group,受冷,盐胁迫
AB值：
0.28118
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