典型文献
2016-2017年中国部分地区TTSuV2流行情况调查与遗传进化分析
文献摘要：
为了解2016-2017年中国地区TTSuV2的流行情况以及流行毒株的遗传演化情况,对中国东北、华中、华东、华北、华南、西南、西北7个地区采集的325份仔猪腹泻样品进行PCR检测,并对其中阳性样品的基因组高变区进行克隆与遗传演化分析.结果显示:TTSuV2阳性样品总数为92份,总阳性率为28.31％;成功克隆出目的基因31条,均属于Kappatorquevirus属的TTSuV k2a基因型,且分布于Group1和Group2.基于全长目的基因同源性分析结果显示,31株TTSuV2型鉴定毒株之间的核苷酸同源性为87.5％～99.7％.UTR核苷酸序列比对结果显示,所有鉴定毒株的核苷酸突变位点主要集中在第51～230 nt.ORF2蛋白序列比对结果显示,所有鉴定毒株的氨基酸突变位点主要集中在第39～49 aa;ORF1蛋白序列比对结果显示,氨基酸突变位点主要集中在第19～50 aa.重组分析结果显示,共存在1株潜在重组毒株TTSuV/515.ORF2基因选择压力分析结果显示,3个密码子位点受到正选择压力,4个密码子位点受到负选择压力.
文献关键词：
猪细环病毒2型;流行情况;遗传演化分析
中图分类号：
作者姓名：
王德海;陈文文;朱金海;李春秋;李鹏;孙东波
作者机构：
黑龙江八一农垦大学动物科技学院,大庆 163319
文献出处：
引用格式：
[1]王德海;陈文文;朱金海;李春秋;李鹏;孙东波-.2016-2017年中国部分地区TTSuV2流行情况调查与遗传进化分析)[J].黑龙江八一农垦大学学报,2022(06):45-55,76
A类：
TTSuV2,Kappatorquevirus,TTSuV,k2a,Group2
B类：
流行情况,情况调查,遗传进化分析,中国地区,流行毒株,演化情况,中国东北,华中,华东,华南,仔猪腹泻,中阳,遗传演化分析,目的基因,基因型,Group1,全长,同源性分析,UTR,序列比对,核苷酸突变,突变位点,nt,ORF2,氨基酸突变,aa,ORF1,重组分析,重组毒株,基因选择,压力分析,密码子,正选择压力
AB值：
0.297865
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