典型文献
2020年黑河市某规模化牛场BAstV检测及ORF1a基因遗传变异分析
文献摘要:
为调查2020年黑河市某规模化奶牛养殖场中牛星状病毒(bovine astrovirus,BAstV)的感染及遗传进化情况,应用RT-PCR方法对该牛场的腹泻样品进行检测,并对BAstV ORF1a基因进行扩增、测序以及遗传进化分析.结果表明,15份腹泻粪便样品中,BAstV的检测阳性率为20%(3/15),对测序成功的2株BAstV毒株进行序列分析显示,鉴定的2株BAstV毒株的核苷酸与氨基酸同源性分别为99.3%和99.4%.2株毒株都与我国BAstV四川流行毒株,登录号NC_037655.1核苷酸同源性较高,分别为96.6%和97.3%,而其与嗜神经型BAstV欧洲毒株,KX266908.1差异较大,核苷酸同源性分别为36.7%和37.4%.系统发育进化树结果显示,试验鉴定的2株BAstV与已报道的其他中国BAstV流行参考毒株关系密切.
文献关键词:
BAstV;ORF1a基因;遗传进化分析
中图分类号:
作者姓名:
杨硕;朱庆贺;王笑冉;孙东波
作者机构:
黑龙江八一农垦大学,大庆 163319;黑龙江省农业科学院畜牧兽医分院
文献出处:
引用格式:
[1]杨硕;朱庆贺;王笑冉;孙东波-.2020年黑河市某规模化牛场BAstV检测及ORF1a基因遗传变异分析)[J].黑龙江八一农垦大学学报,2022(02):52-58
A类:
BAstV,KX266908
B类:
黑河市,规模化牛场,ORF1a,基因遗传变异,遗传变异分析,奶牛养殖,牛养殖场,牛星状病毒,bovine,astrovirus,遗传进化分析,粪便样品,检测阳性率,序列分析,同源性,川流,流行毒株,登录号,NC,系统发育进化树,试验鉴定
AB值:
0.247646
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