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典型文献
猪博卡病毒1型nPCR检测方法的建立与SXWN20株基因序列分析
文献摘要:
建立了检测猪博卡病毒1型(PBoV)的nPCR方法,对陕西省部分猪群PBoV1型感染情况进行流行病学调查.通过优化反应体系与条件,测试了方法的灵敏性和特异性,建立了 PBoV1型nPCR检测方法,并对阳性样品进行测序分析.结果表明,建立nPCR方法检测PBoV1型单链DNA的极限为4.742×10-2 ng/μL,该方法与PCV2、PCV3、PPV、猪链球菌和猪大肠杆菌DNA均无交叉反应,特异性良好.检测了陕西省猪场60份样品,PBoV1型阳性率为3.33%(2/60).测序获得的SXWN20株VP1/VP2基因序列比对发现,SXWN20株与参比的PBoV1型毒株核苷酸同源性为96.6%~97.5%,与PBoV2/3/4/5型同源性仅为53.8%~59.7%.进化树分析显示,所有参比毒株分为3个大分支,SXWN20株与PBoV1型毒株处在一个进化分支,PBoV2型处在一个进化分支,PBoV3/4/5型处在一个进化分支.
文献关键词:
猪博卡病毒;核酸检测;序列分析;聚合酶链式反应
作者姓名:
朱小甫;吴旭锦;郑红青;尹宝英;熊忙利;张文娟;张兆顺
作者机构:
咸阳职业技术学院,咸阳市动物疫病分子生物学诊断技术研究重点实验室,陕西咸阳 712000
文献出处:
引用格式:
[1]朱小甫;吴旭锦;郑红青;尹宝英;熊忙利;张文娟;张兆顺-.猪博卡病毒1型nPCR检测方法的建立与SXWN20株基因序列分析)[J].陕西农业科学,2022(11):82-86
A类:
猪博卡病毒,SXWN20,PBoV,PBoV1,PBoV2,PBoV3
B类:
nPCR,基因序列分析,猪群,感染情况,流行病学调查,优化反应,反应体系,灵敏性,测序分析,单链,PCV2,PCV3,PPV,猪链球菌,猪大肠,大肠杆菌,交叉反应,猪场,VP1,VP2,基因序列比对,参比,毒株,同源性,进化树分析,进化分支,核酸检测,聚合酶链式反应
AB值:
0.2555
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