典型文献
睡莲WRKY家族的全基因组鉴定和分子进化分析
文献摘要：
在睡莲中共鉴定出69个NcWRKY转录因子,将其分成3个亚家族,即Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ,其中Ⅱ亚家族可进一步分为Ⅱa、Ⅱb、Ⅱc、Ⅱd和Ⅱe,与拟南芥中WRKY亚家族分类相同.Ⅱc亚家族中含有17个成员,是睡莲WRKY家族中成员数最多的亚家族.所有成员的蛋白质二级结构中无规则卷曲所占比例高达为39％～78％.motif 1和motif 3被注释为WRKY保守结构.NcWRKY成员在睡莲14条染色体中均有分布,其中Ⅱa亚家族中所有成员都定位在Nc4号染色体.启动子顺式调控元件分析发现,NcWRKY成员广泛参与激素调控反应,通过不同组织中表达量分析筛选出在成熟叶柄中高表达的NcWRKY04与NcWRKY18,在花瓣中高表达的McpRKY05和在雄蕊中高表达的NcWRKY61.基因复制事件分析发现,NcWRKY家族主要以片段复制事件为主.基因表达网络关系分析预测NcWRKY61和NcWRKY63可能与其他成员有共表达关系.
文献关键词：
睡莲;WRKY;全基因组鉴定;分子进化
中图分类号：
作者姓名：
潘鑫峰;叶方婷;毛志君;李兆伟;范凯
作者机构：
福建农林大学农学院,作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室,福州350002
文献出处：
引用格式：
[1]潘鑫峰;叶方婷;毛志君;李兆伟;范凯-.睡莲WRKY家族的全基因组鉴定和分子进化分析)[J].园艺学报,2022(05):1121-1135
A类：
NcWRKY,Nc4,NcWRKY04,NcWRKY18,McpRKY05,NcWRKY61,NcWRKY63
B类：
睡莲,全基因组鉴定,分子进化,进化分析,亚家族,拟南芥,家族分类,成员数,数最多,蛋白质二级结构,无规则,卷曲,motif,启动子,顺式调控元件,激素调控,调控反应,不同组织,组织中表达,表达量分析,成熟叶,叶柄,花瓣,雄蕊,基因复制事件,事件分析,网络关系,关系分析,分析预测,共表达,表达关系
AB值：
0.301262
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
