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典型文献
小豆Dirigent基因家族鉴定及锈菌侵染对不同成员表达的影响
文献摘要:
为明确Dirigent(DIR)基因在小豆抗锈病中的作用,采用生物信息学方法,对小豆DIR基因家族(VaDIRs)进行了全基因组鉴定,结果发现小豆中共有33个DIR基因,其中29个成员分别定位在8条染色体上,系统进化分析表明,VaDIRs包括DIR-a、DIR-b/d、DIR-e和DIR-f四个亚家族,对VaDIRs成员启动子区顺式作用元件的分析发现,VaDIRs启动子区均包含激素、病原体应答等元件.对小豆抗锈病品种接种后不同时间的转录组数据分析发现,差异表达基因中共有17个VaDIRs成员,其中6个于接种后24 h显著上调,2个于接种后24 h和48 h均高量表达.进一步应用qRT-PCR技术对上述8个基因在抗、感品种中应答锈菌侵染的表达分析表明,高抗品种中VaDIR14、VaDIR16和VaDIR33的表达量在锈菌侵染不同阶段均显著高于感病品种.上述结果表明,VaDIRs家族成员可作为正调节因子参与小豆对锈病的抗性.
文献关键词:
小豆(Vigna angularis);小豆锈病;豇豆单胞锈菌(Uromyces vignae);DIR基因;基因家族
作者姓名:
柯希望;苑梦琦;徐晓丹;殷丽华;郭永霞;左豫虎
作者机构:
黑龙江八一农垦大学农学院/黑龙江省作物有害生物互作生物学及生态防控重点实验室/国家杂粮工程技术研究中心,黑龙江大庆163319
文献出处:
引用格式:
[1]柯希望;苑梦琦;徐晓丹;殷丽华;郭永霞;左豫虎-.小豆Dirigent基因家族鉴定及锈菌侵染对不同成员表达的影响)[J].作物学报,2022(11):2774-2785
A类:
Dirigent,VaDIRs,VaDIR14,VaDIR16,VaDIR33,小豆锈病,vignae
B类:
基因家族鉴定,侵染,抗锈,生物信息学方法,全基因组鉴定,系统进化分析,亚家族,启动子区,顺式作用元件,病原体,转录组数据,差异表达基因,qRT,表达分析,高抗,调节因子,Vigna,angularis,豇豆单胞锈菌,Uromyces
AB值:
0.177651
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