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2021年宁夏回族自治区聚集性新型冠状病毒肺炎疫情分子流行病学分析
文献摘要：
目的 分析2021年10月宁夏回族自治区(宁夏)新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情的分子流行病学特征,为完善防控措施提供科学依据.方法 收集2021年10月17日至11月6日宁夏COVID-19确诊病例的发病时间、病例分布、人群特征、基因测序结果等信息,进行描述性分析.结果 宁夏2021年10月聚集性疫情共确诊COVID-19病例44例,本轮疫情有2个独立的传播链,平均代间距约4 d,潜伏期中位数为5.3 d(1.1～8.0 d),最多已传代至3代;获得43例COVID-19病例的全基因组序列,结果表明本起疫情是由VOC/Delta变异株(B.1.617.2进化分支)感染,同武汉参考株(NC_045512)序列相比,43例病例新型冠状病毒(SARS-CoV-2)基因组序列存在45～50个核苷酸突变位点;SARS-CoV-2刺突(S)蛋白存在12个氨基酸突变位点.结论 Delta毒株导致的疫情呈现出病毒载量高,潜伏期短,传播能力强的特点,境外输入的SARS-CoV-2变异株存在引起本地暴发与流行的风险,需持续对境外输入的SARS-CoV-2毒株进行分子监测.
文献关键词：
新型冠状病毒;新型冠状病毒肺炎;流行病学;高通量测序
中图分类号：
作者姓名：
裴建新;刘翔;龚瑞;马学平;李涛;张银豪;蒯文和;赵建华;司冰倩;吴忠兰
作者机构：
宁夏回族自治区疾病预防控制中心,宁夏银川750004;宁夏医科大学公共卫生学院,宁夏银川750001
文献出处：
引用格式：
[1]裴建新;刘翔;龚瑞;马学平;李涛;张银豪;蒯文和;赵建华;司冰倩;吴忠兰-.2021年宁夏回族自治区聚集性新型冠状病毒肺炎疫情分子流行病学分析)[J].疾病监测,2022(09):1192-1197
A类：
B类：
宁夏回族自治区,新型冠状病毒肺炎疫情,情分,分子流行病学,流行病学分析,流行病学特征,确诊病例,发病时间,人群特征,基因测序,描述性分析,聚集性疫情,本轮,传播链,潜伏期,中位数,传代,全基因组序列,VOC,Delta,变异株,进化分支,NC,SARS,CoV,核苷酸突变,突变位点,氨基酸突变,毒株,病毒载量,传播能力,境外输入
AB值：
0.267976
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