典型文献
基于宏基因组学分析湘西腊肉的细菌多样性
文献摘要:
目的 解析湘西成熟腊肉制品中微生物群落结构和种群丰度.方法 采集湖南慈利县、辰溪县和古丈县3个样地成熟腊肉样品,提取样品细菌总DNA,利用454焦磷酸高通量测序法进行测序,并进行生物信息学分析.结果 从慈利腊肉获得10449条优质序列,聚类得到132个OTUs,注释为8个菌门,鉴定出82个属;其中变形菌门为主要细菌类群,占比90.1%;葡萄球菌属为优势菌属,占比47.6%.辰溪腊肉获得10719条优质序列,聚类得到70个OTUs,归入5个菌门,37个菌属,变形菌门占比54.2%,为优势菌门;葡萄球菌属为第一大菌属,占比65.5%.古丈腊肉获得15577条优质序列,聚类得到97个OTUs,分属于9个菌门,52个菌属,其中厚壁菌门占比84.5%,为最丰富的类群;葡萄球菌属为优势属,占比71.1%.3地区腊肉样品群落多样性高低依次为辰溪>慈利>古丈,湘西成熟腊肉中优势细菌类群为葡萄球菌,其次为鞘氨醇单胞菌和嗜冷杆菌.鞘氨醇单胞菌在腊肉样品中作为优势菌群为首次报道.结论 湘西成熟腊肉中蕴含着丰富的微生物类群,鞘氨醇单胞菌可能与湘西腊肉独特风味形成有一定关联.
文献关键词:
湘西腊肉;宏基因组;高通量测序;群落结构;优势菌群
中图分类号:
作者姓名:
熊力;易浪波;粟桂蓉;周璐璐;彭清忠
作者机构:
吉首大学生物资源与环境科学学院,湖南吉首416000
文献出处:
引用格式:
[1]熊力;易浪波;粟桂蓉;周璐璐;彭清忠-.基于宏基因组学分析湘西腊肉的细菌多样性)[J].中国微生态学杂志,2022(01):23-28
A类:
湘西腊肉
B类:
宏基因组学,基因组学分析,细菌多样性,肉制品,微生物群落结构,慈利县,辰溪县,古丈县,样地,肉样,焦磷酸,高通量测序法,生物信息学分析,OTUs,变形菌门,细菌类群,葡萄球菌属,归入,分属,厚壁菌门,优势属,群落多样性,鞘氨醇单胞菌,优势菌群,首次报道,生物类,风味形成
AB值:
0.200965
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