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典型文献
果实红色与黄色番茄品种植株茎部内生细菌群落结构及代谢功能特征
文献摘要:
[目的]比较果实颜色分别为红色和黄色的番茄植株茎部内生细菌群落组成及代谢功能特征,旨在探究番茄果色形成与植株内生细菌的关联,为构建番茄育种新型的评价体系,以及开发利用有益微生物功能提供理论依据和技术支撑.[方法]基于MiSeq高通量测序技术,分析果实颜色分别为红色和黄色番茄品种植株茎部内生细菌群落组成及相关代谢功能生物信息学分析.[结果]果实颜色分别为红色和黄色番茄品种植株茎部中,短状杆菌属(Brachybacterium)、未分类大肠杆菌属(unclassified_f_Enterobacteriaceae)、乳酸杆菌属(Lactobacillus)、棒杆菌属(Corynebacterium)、绿脓杆菌属(Pseudomaonas)、微杆菌属(Microbacterium)、norank_f_norank_o_Gaiellales、褚氏杆菌属(Chujaibacter)、鞘氨醇单胞杆菌属(Sphigomonas)细菌是红色番茄品种植株茎部特有的优势内生细菌属;短小杆菌属(Curtobacterium)、norank_f _Mitochondria、拟无枝酸菌属(Amycolatopsis)和束毛球菌属(Trichococcus)是黄色番茄品种植株茎部特有的优势的内生细菌属.此外,果实颜色为红色的番茄品种植株茎部中,拥有比黄色番茄品种更为丰富的内生细菌属与基因功能.[结论]果实颜色分别为红色和黄色的番茄品种植株茎部,形成了特异的内生细菌群落组成与功能,红色品种拥有比黄色品种更丰富的特有优势内生细菌属与基因功能,番茄果实颜色形成与植株内生细菌的群落组成与功能紧密相关.
文献关键词:
番茄;内生细菌;高通量测序;功能预测
作者姓名:
陈思宇;孙妍;肖健;赵天义;杨尚东
作者机构:
广西大学农学院,植物科学国家级实验教学示范中心,广西南宁530004;广西钦州市农业技术推广中心,广西钦州535099
文献出处:
引用格式:
[1]陈思宇;孙妍;肖健;赵天义;杨尚东-.果实红色与黄色番茄品种植株茎部内生细菌群落结构及代谢功能特征)[J].微生物学报,2022(02):602-616
A类:
Brachybacterium,Pseudomaonas,Sphigomonas,Curtobacterium,Trichococcus
B类:
番茄品种,植株,茎部,内生细菌群落结构,代谢功能,功能特征,果实颜色,细菌群落组成,果色,育种,有益微生物,微生物功能,MiSeq,高通量测序技术,生物信息学分析,未分类,大肠杆菌,肠杆菌属,unclassified,Enterobacteriaceae,乳酸杆菌,Lactobacillus,Corynebacterium,绿脓杆菌,微杆菌,Microbacterium,norank,Gaiellales,氏杆菌,Chujaibacter,鞘氨醇,短小杆菌属,Mitochondria,拟无枝酸菌,Amycolatopsis,基因功能,番茄果实,功能预测
AB值:
0.248386
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