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典型文献
长江三峡上游水域细菌群落结构与功能预测
文献摘要:
[目的]揭示三峡附近支流和长江干流细菌群落组成,共现网络特征和对网络有重要作用的中心节点微生物,进一步研究三峡上游水域细菌群落的代谢功能.[方法]本研究于长江北岸四条一级支流和附近干流(香溪河、大宁河、朱衣河、梅溪河、长江干流)采集水样,基于16SrRNA基因Pacbio测序技术和生物信息学方法分析细菌群落结构,Tax4Fun功能预测分析细菌群落的代谢功能.[结果](1)长江三峡上游水域主要优势菌门为变形菌门(Proteobacteria,66.4%)、拟杆菌门(Bacteroidetes,13.2%)和蓝细菌门(Cyanobacteria,6.2%).变形菌门中,γ-变形菌最为丰富,其次是α-变形菌.多样性指数和丰富度指数表明研究区域微生物种类较为丰富.(2)共现网络分析结果表明,长江三峡上游附近水域网络具有"小世界"特征,鞘脂单胞菌科(Sphingomonadaceae)、绿弯菌门(Chloroflexi)、出芽菌科(Gemmataceae)、弯曲杆菌(Flectobacillus)和蟑螂杆状体科(Cryomorphaceae)是对共现网络结构有重要作用的中心节点微生物,在群落结构和多样组成中扮演着重要角色.(3)Tax4Fun功能预测共发现6个一级功能和42个二级功能,长江三峡上游水域细菌群落代谢比较活跃.[结论]长江三峡上游水域细菌群落多样性高,中心节点微生物多为稀有微生物,稀有微生物在维持群落结构中发挥重要作用.细菌群落代谢功能分析表明,长江三峡上游水域细菌群落代谢途径丰富,有益于水域的水体健康.了解微生物群落的分布和相互作用特征,将为长江生态系统的健康发展、水资源的利用和水环境的改善提供基础数据和科学依据.
文献关键词:
三峡上游水域;细菌群落结构;共现网络;Tax4Fun功能预测
作者姓名:
杨艳;王浩;李凯航;李贝贝;张琦;王子权;金一;何晓青
作者机构:
北京林业大学生物科学与技术学院,北京100083
文献出处:
引用格式:
[1]杨艳;王浩;李凯航;李贝贝;张琦;王子权;金一;何晓青-.长江三峡上游水域细菌群落结构与功能预测)[J].微生物学报,2022(04):1401-1415
A类:
三峡上游水域,Gemmataceae,Flectobacillus,Cryomorphaceae
B类:
长江三峡,细菌群落结构,群落结构与功能,功能预测,近支,支流,长江干流,细菌群落组成,网络特征,中心节点,代谢功能,于长江,江北岸,四条,香溪河,大宁河,梅溪河,集水,水样,16SrRNA,Pacbio,生物信息学方法,Tax4Fun,预测分析,主要优势,优势菌,变形菌门,Proteobacteria,拟杆菌门,Bacteroidetes,蓝细菌,Cyanobacteria,多样性指数,丰富度,生物种类,共现网络分析,小世界,鞘脂,单胞菌,Sphingomonadaceae,Chloroflexi,出芽,蟑螂,杆状,细菌群落多样性,稀有,功能分析,代谢途径,有益于,微生物群落,作用特征
AB值:
0.264817
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