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基于TCGA数据库的肝细胞癌铁死亡相关LncRNA风险预测模型的构建
文献摘要：
目的 基于The Cancer Genome Atlas(TCGA)数据库建立肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)的铁死亡相关长链非编码RNA(LncRNA)风险预测模型.方法 通过TCGA数据库下载HCC基因表达谱数据和临床信息,获取LncRNA表达数据,从铁死亡基因数据库(FerrDb)下载的铁死亡基因和LncRNA进行共表达分析确定铁死亡相关LncRNA,通过单因素和多因素COX分析建立LncRNA预测模型,分析模型高、低风险组间生物学通路富集的差异和免疫相关功能差异.结果 共纳入22个LncRNA组成预测模型,该模型1年、3年和5年的生存预测性能AUC值分别为0.811、0.778和0.752,高风险组患者的总生存期(OS)明显低于低风险组(P<0.05).进一步分析表明免疫细胞及功能和免疫检查点在高、低风险组中存在差异.结论 22个LncRNA组成的风险预测模型可作为独立预测因子来有效预测HCC的预后.
文献关键词：
肝细胞癌;铁死亡;TCGA数据库;LncRNA;COX回归模型
中图分类号：
作者姓名：
王少波;郭跃;曾昊;庞志刚
作者机构：
郑州大学第二附属医院普外科,河南 郑州 450000
文献出处：
引用格式：
[1]王少波;郭跃;曾昊;庞志刚-.基于TCGA数据库的肝细胞癌铁死亡相关LncRNA风险预测模型的构建)[J].中国现代医药杂志,2022(04):14-19
A类：
B类：
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AB值：
0.377869
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