典型文献
基于TCGA数据库探究可溶性因子对乳腺癌患者的预后作用
文献摘要：
目的 探讨可溶性因子对乳腺癌患者的预后影响.方法 通过癌症基因图谱(TCGA)数据库下载乳腺癌患者的转录组数据及临床数据,通过差异分析及生存分析得到可溶性因子预后相关基因.对可溶性因子预后相关基因进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)、基因本体论(GO)与京都基因和基因组百科全书(KEGG)分析,并构建预后模型.最后对预后模型的高、低风险组进行免疫浸润分析.结果 通过差异分析及生存分析得到27个预后相关的可溶性因子的差异基因.PPI结果显示,可溶性因子预后相关基因相互间存在较强的相互作用,其中IL-7、IL-4、IL-16、CCL5、CXCL13、CXCL9、CXCL1、LTA等相互作用.GO分析表明可溶性因子预后相关基因参与补体的激活、免疫球蛋白复合物形成、趋化因子形成等过程.KEGG分析表明,可溶性因子预后相关基因与NF-κB信号传导途径、Th1和Th2细胞分化、TNF信号传导途径、IL-17等信号传导途径密切相关.可溶性因子预后模型高风险组的生存时间显著低于低风险组(P<0.01).免疫浸润分析结果表明,高风险组中所有的免疫细胞及免疫功能评分均发生了降低.结论 可溶性因子相关基因的表达可通过影响机体的免疫功能、信号传导等途径干预乳腺癌患者的预后.
文献关键词：
可溶性因子;乳腺癌;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
刘孟晨;孙贻安;李静蔚
作者机构：
250014 济南,山东中医药大学第一临床医学院;山东中医药大学附属医院乳腺甲状腺外科
文献出处：
引用格式：
[1]刘孟晨;孙贻安;李静蔚-.基于TCGA数据库探究可溶性因子对乳腺癌患者的预后作用)[J].浙江医学,2022(15):1606-1613
A类：
B类：
TCGA,可溶性因子,乳腺癌患者,预后作用,预后影响,癌症基因图谱,下载,转录组数据,临床数据,生存分析,预后相关基因,蛋白质相互作用,PPI,基因本体论,京都基因和基因组百科全书,预后模型,低风险组,免疫浸润,差异基因,相互间,CCL5,CXCL13,CXCL9,LTA,补体,免疫球蛋白,复合物,趋化因子,信号传导,传导途径,Th1,Th2,细胞分化,高风险组,生存时间,免疫细胞,功能评分
AB值：
0.228857
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