典型文献
人源TNF-α蛋白生物信息学分析及相关治疗思路研究
文献摘要：
目的 应用生物信息学分析软件预测并分析人源肿瘤坏死因子-α(TNF-α)蛋白结构和功能,并结合该课题组前期实验结果提出一些新的治疗思路.方法 利用在线Uniprot蛋白数据库、Expasy在线预测网站、SignalP-5.0、TMHMM Server V2.0、Cell-Ploc、SOPMA、SWISS-MODEL、在线数据库Protscale等生物信息学预测软件对人源TNF-α蛋白理化性质、信号肽、跨膜区、亚细胞定位、空间结构及疏水性分析;登录"ht-tp://"网站对该蛋白磷酸化位点进行预测;选取String及IEDB等在线网站分析人源TNF-α的相互作用蛋白及该蛋白优势表位预测.结果 人源TNF-α蛋白为编码233个氨基酸的蛋白质,相对分子质量为26×103,为不太稳定的亲水性蛋白,有跨膜区,无信号肽;预测该蛋白亚细胞定位在细胞膜中,蛋白序列中存在15个丝氨酸磷酸化位点,二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主;三级结构模型显示该蛋白可形成同源三聚体,有多种蛋白与之相互作用.结论 生物信息学预测分析人源TNF-α含有多个磷酸化位点和B细胞优势表位,并且该表位与前期实验找到的功能性肽段序列相符,可为临床针对人源TNF-α设计多肽或药物提供新靶点.
文献关键词：
肿瘤坏死因子-α;生物信息学分析;治疗;预测
中图分类号：
作者姓名：
蹇艾利;申元英;姜石松
作者机构：
云南大理大学基础医学院微生物学及免疫学教研室,云南大理 671000;英国牛津大学肿瘤系,英国牛津 OX37DQ
文献出处：
引用格式：
[1]蹇艾利;申元英;姜石松-.人源TNF-α蛋白生物信息学分析及相关治疗思路研究)[J].现代医药卫生,2022(12):1981-1985
A类：
Ploc
B类：
生物信息学分析,治疗思路,思路研究,软件预测,蛋白结构,结构和功能,合该,Uniprot,Expasy,在线预测,测网,SignalP,TMHMM,Server,V2,Cell,SOPMA,SWISS,MODEL,Protscale,预测软件,信号肽,疏水性,登录,ht,tp,蛋白磷酸化,String,IEDB,线网,相互作用蛋白,白及,表位预测,相对分子质量,亲水性,蛋白亚细胞定位,细胞膜,丝氨酸,二级结构,无规则,卷曲,三级结构,三聚体,种蛋,预测分析,段序列,多肽,新靶点
AB值：
0.42776
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