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新型冠状病毒非结构蛋白3结构和功能的生物信息学分析
文献摘要：
目的 利用生物信息学方法分析新型冠状病毒非结构蛋白3(NSP3)的生物学特征.方法 在NCBI数据库获得NSP3氨基酸序列,利用软件分析其分子式、等电点、亲水性、跨膜结构域、蛋白翻译后修饰、二级结构、抗原表位等特点,并构建其三级结构.结果 NSP3由1945个氨基酸组成,分子式为C9722H15175N2489O2969S88,是一种含有4个跨膜结构域的稳定亲水蛋白质.二级结构以无规卷曲为主(占45.1％),含有丰富的磷酸化位点、糖基化位点、泛素化位点、SUMO化位点、甲基化位点、乙酰化位点、琥珀酰化位点和棕榈酰化位点.NSP3含有15个二硫键,具有7个保守蛋白结构域,存在丰富的抗原表位,主要分布于内质网.并以同源建模法构建其三级结构模型.结论 利用生物信息学方法分析NSP3的性质、结构、功能特征和抗原表位,为新冠肺炎的防控和药物研发提供参考依据.
文献关键词：
新型冠状病毒;非结构蛋白3;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
丁一;宋峰;刘烁;江亚娟;王小羽;焦伯延
作者机构：
济宁市疾病预防控制中心,山东 济宁 272000
文献出处：
引用格式：
[1]丁一;宋峰;刘烁;江亚娟;王小羽;焦伯延-.新型冠状病毒非结构蛋白3结构和功能的生物信息学分析)[J].智慧健康,2022(32):34-37,54
A类：
C9722H15175N2489O2969S88
B类：
非结构蛋白,结构和功能,生物信息学分析,利用生物,生物信息学方法,NSP3,生物学特征,NCBI,氨基酸序列,利用软件,分子式,等电点,亲水性,跨膜结构域,蛋白翻译后修饰,二级结构,抗原表位,其三,三级结构,氨基酸组成,定亲,亲水蛋白质,无规,卷曲,磷酸化,糖基化位点,泛素化,SUMO,甲基化位点,乙酰化,琥珀酰化,棕榈酰化,二硫键,蛋白结构域,内质网,同源建模,功能特征,药物研发
AB值：
0.321585
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