典型文献
葡萄糖转运体8的生物信息学分析
文献摘要：
目的 利用生物信息学方法分析GLUT8蛋白的结构和功能.方法从NCBI数据库中获取GLUT8的基因序列和氨基酸序列,通过ProtParam和ProtScale分析GLUT8的理化性质和亲疏水性;通过TMHMM、SignalP和ProtCrop-Version分析GLUT8的跨膜结构域、信号肽和亚细胞定位;通过YinOYang 1.2 Server和NecNGlyc 1.0 Server分析GLUT8的糖基化情况;通过NetPho 3.1分析GLUT8的磷酸化位点;通过SOPMA、SWISS-MEDOL分析GLUT8的二级和三级结构;通过Uiprot中的Inertation数据库分析GLUT8的二元相互作用;通过STRING分析GLUT8的蛋白相互作用分析.结果GLUT8蛋白由SLC2A8编码,位于9q33.3,全长10 759 bp,包含11个外显子,共477个氨基酸,其中丙氨酸(Ala)占12.8％,亮氨酸(Leu)占13.8％,其他氨基酸的占比均小于10％.GLUT8蛋白共有12个跨膜结构域,其主要定位于细胞膜和细胞质内.GLUT8蛋白共有5个O-糖基化位点,分别在47、333、350、356、360位;有1个N-糖基化位点,在349位.GLUT8蛋白共有24个磷酸位点,其中丝氨酸(Ser)磷酸化位点12个,苏氨酸(Thr)磷酸化位点10个,酪氨酸(Tyr)磷酸化位点2个.GLUT8蛋白二级结构以α-螺旋为主,三级结构中GEMQ评分为0.63分,平均QMEAN评分为(0.66±0.05)分.GLUT8蛋白共与46个蛋白有二元相互作用,与10个蛋白有相互作用.结论GLUT8为12次跨膜蛋白,有多个糖基化位点和磷酸化位点,与多个蛋白相互作用,参与多条信号通路.
文献关键词：
葡萄糖转运体;氨基酸序列;理化性质;亲疏水性
中图分类号：
作者姓名：
高晗;赵贝
作者机构：
大理大学基础医学院,云南 大理671000
文献出处：
引用格式：
[1]高晗;赵贝-.葡萄糖转运体8的生物信息学分析)[J].医学信息,2022(12):26-31
A类：
ProtCrop,YinOYang,NecNGlyc,NetPho,MEDOL,Uiprot,Inertation,SLC2A8,9q33,GEMQ,QMEAN
B类：
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AB值：
0.259706
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