典型文献
基于生物信息学方法的沙眼衣原体主要外膜蛋白免疫优势表位预测及分析
文献摘要：
目的 预测和分析沙眼衣原体主要外膜蛋白(MOMP)的免疫优势表位.方法 以UniProt蛋白质数据库中检索Ct MOMP的氨基酸序列为基础,针对MOMP的理化性质、二级结构、亲水性参数、表面可及性参数、极性参数、抗原性和柔韧性参数,预测其B细胞表位;用SYFPEITHI、IEDB及Net CTI 1.2 server预测MOMP的细胞毒性T淋巴细胞(CTL)表位;用RANKPEP及SYFPEITHI预测MOMP的辅助T细胞(Th)表位,筛选分值共同较高的多肽片段作为候选表位.应用Galaxy WEB对MOMP进行三维结构建模分析.结果 MOMP由393个氨基酸残基组成,以无规则卷曲及α螺旋为主;推测MOMP的B细胞表位位于N端42～52 aa、161～179 aa、259～265 aa和349～358 aa区段;其CTL表位主要集中于近C端,且以HLA-A*02:01、HLA-A*03限制性表位为主;Th表位各表型候选表位肽数目均较多.结论 沙眼衣原体MOMP含有潜在的B细胞和T细胞抗原表位,其免疫优势表位主要位于N端42～65 aa、155～185 aa区段和C端342～359 aa区段.
文献关键词：
沙眼衣原体;主要外膜蛋白;抗原表位;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
李明洋;徐远久;鲁小龙;张雷;苏惠婷;朱珊丽;张友秀
作者机构：
四川大学华西广安医院检验科,四川广安638000;温州医科大学分子病毒与免疫研究所微生物学与免疫学教研室;四川大学华西广安医院外围手术室
文献出处：
引用格式：
[1]李明洋;徐远久;鲁小龙;张雷;苏惠婷;朱珊丽;张友秀-.基于生物信息学方法的沙眼衣原体主要外膜蛋白免疫优势表位预测及分析)[J].山东医药,2022(20):24-29
A类：
RANKPEP
B类：
生物信息学方法,沙眼衣原体,主要外膜蛋白,免疫优势,表位预测,MOMP,UniProt,蛋白质数据库,Ct,氨基酸序列,二级结构,亲水性,可及性,抗原性,柔韧性,细胞表位,SYFPEITHI,IEDB,Net,CTI,server,细胞毒性,CTL,Th,多肽,Galaxy,WEB,三维结构,结构建模,建模分析,氨基酸残基,基组,无规则,卷曲,aa,区段,HLA,限制性,表位肽,抗原表位
AB值：
0.297665
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
