典型文献
hsa-miR-106b-5p调控ESR1表达对肝细胞癌患者生存预后的意义
文献摘要：
目的 利用生物信息学方法,分析hsa-miR-106b-5p调控ESR1在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中的表达及其生存预后意义.方法 利用BART和StarBase数据库筛选GSE108724芯片的差异miRNAs及其与HCC患者生存预后的关系;利用TargetScan和MetaScape数据库分析miRNAs的靶基因及其GO和KEGG富集分析,并利用String数据库和Cy-toscape软件筛选靶基因中的HUB基因;对HUB基因进行生存预后分析及其与miRNAs的结合位点分析;通过临床数据构建HUB基因在HCC中的风险预测模型,并利用C-index、校准曲线(CC)、决策曲线分析(DCA)以及ROC曲线对预测模型进行评价.结果 共得到5个差异miRNAs,仅hsa-miR-106b-5p对HCC患者生存预后有显著意义;hsa-miR-106b-5p的靶基因有644个,其KEGG主要富集在Rap1信号通路、MAPK信号通路和癌症信号通路上;GO功能主要富集在跨膜受体蛋白酪氨酸激酶、Ras GTPase结合和分解代谢调控等上;HUB基因中仅ESR1在HCC中低表达,并对HCC患者的生存预后有显著意义,且ESR1 mRNA 3'UTR直接与hsa-miR-106b-5p结合;Logistic回归分析发现低表达的ESR1是HCC患者生存预后的独立危险因素;且所构建的风险预测模型具有较好的准确性和有效性.结论 hsa-miR-106b-5p调控ESR1使其在HCC中低表达,且不利于HCC患者的生存预后,可作为HCC的潜在治疗靶点.
文献关键词：
生物信息学;肝细胞癌;基因;肿瘤
中图分类号：
作者姓名：
陆进;安韶光;马俊杰;俞鹏;陶恒;陈云帆;张浩轩
作者机构：
蚌埠医学院人体解剖学教研室,安徽 蚌埠 233030;蚌埠医学院数字医学与智慧健康安徽省重点实验室,安徽 蚌埠 233030;蚌埠医学院临床医学院,安徽 蚌埠 233030
文献出处：
引用格式：
[1]陆进;安韶光;马俊杰;俞鹏;陶恒;陈云帆;张浩轩-.hsa-miR-106b-5p调控ESR1表达对肝细胞癌患者生存预后的意义)[J].牡丹江医学院学报,2022(05):27-34
A类：
GSE108724
B类：
hsa,106b,5p,ESR1,肝细胞癌,生存预后,利用生物,生物信息学方法,hepatocellular,carcinoma,HCC,预后意义,BART,StarBase,miRNAs,TargetScan,MetaScape,数据库分析,靶基因,富集分析,String,Cy,toscape,HUB,预后分析,结合位点,临床数据,风险预测模型,校准曲线,决策曲线分析,DCA,Rap1,MAPK,膜受体,受体蛋白酪氨酸激酶,Ras,GTPase,分解代谢,代谢调控,低表达,UTR,潜在治疗,治疗靶点
AB值：
0.310418
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