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典型文献
基于网络药理学分析三七总皂苷通过外泌体miR-21干预缺血性脑卒中作用机制
文献摘要:
目的 利用生物信息学方法探讨外泌体miR-21和三七总皂苷在缺血性脑卒中治疗的分子作用机制及调控网络.方法 使用多个数据库查询三七总皂苷活性成分及靶基因、外泌体miR-21和缺血性脑卒中的靶基因;对共同靶基因进行GO和KEGG分析,使用Cytoscape软件构建活性化合物-靶基因-信号通路网络图和PPI网络图,筛选核心基因.最后运用分子对接对活性化合物和主要靶点进行验证.结果 获得三七总皂苷12个活性成分及47个共同靶基因.PPI网络构建得到10个核心基因:CASP3、EGFR、VEGFA、STAT3、HIF1A、ESR1、BCL2L1、HSP90AA1、PTGS2、MTOR.GO富集分析表明靶基因主要富集在凋亡过程的负调控、一氧化氮生物合成过程的正调控、RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控、细胞增殖的正调控生物学过程项目.KEGG富集分析表明,共同基因主要参与癌症中的蛋白聚糖、HIF-1信号通路、胰脏癌、肿瘤坏死因子信号通路等通路.分子对接表明主要活性成分与核心靶点有较强的结合能力.结论 外泌体miR-21和三七总皂苷通过多靶点、多途径、多通路干预缺血性脑卒中,STAT3、VEGFA、HSP90AA1、BCL2L1、MAPK1是值得关注的靶基因,蛋白多糖与癌症通路是主要调控通路.
文献关键词:
缺血性脑卒中;外泌体;miRNA-21;网络药理学;分子对接
作者姓名:
欧阳扬;刘佩;刘玥彤;杨鎏鑫;黄清;刘蕾;陈维;陈玉珍;方子文;蒙兰青
作者机构:
右江民族医学院研究生学院,广西 百色 533000;右江民族医学院附属医院,广西 百色 533000;粤北人民医院,广东 韶关 512000
引用格式:
[1]欧阳扬;刘佩;刘玥彤;杨鎏鑫;黄清;刘蕾;陈维;陈玉珍;方子文;蒙兰青-.基于网络药理学分析三七总皂苷通过外泌体miR-21干预缺血性脑卒中作用机制)[J].右江民族医学院学报,2022(03):351-358
A类:
B类:
网络药理学,药理学分析,三七总皂苷,外泌体,缺血性脑卒中,利用生物,生物信息学方法,分子作用机制,调控网络,数据库查询,靶基因,Cytoscape,软件构建,活性化合物,通路网络,网络图,PPI,核心基因,分子对接,网络构建,CASP3,EGFR,VEGFA,STAT3,HIF1A,ESR1,BCL2L1,HSP90AA1,PTGS2,MTOR,富集分析,负调控,一氧化氮,生物合成,合成过程,正调控,启动子,生物学过程,蛋白聚糖,胰脏,肿瘤坏死因子信号通路,明主,主要活性成分,核心靶点,结合能,多靶点,多途径,多通路,MAPK1,癌症通路,调控通路,miRNA
AB值:
0.307328
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