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半滑舌鳎细胞分裂周期蛋白42基因克隆与结构预测
文献摘要：
细胞分裂周期蛋白42(Cdc42)是Rho超家族酶中的一个亚类,具有调节细胞骨架和肌动蛋白作用,并参与免疫与炎症反应.设计半滑舌鳎Cdc42基因(即CsCdc42)特异性引物,采用RT-PCR方法、生物信息学方法等进行CsCdc42基因克隆及结构预测.结果获得CsCdc42基因片段长度为847 bp,推测编码191个氨基酸,含有7个抗原表位(27-28、61-63、90-92、120-122、131-133、164-166和181-183 aa)、1个RHO结构域(6-179 aa),其中含有1个ATP/GTP结合位点和1个酰基化位点;蛋白结构预测主要为α螺旋(30.9％)、β折叠(24.6％)和无规则卷曲(44.5％).序列比对结果表明,CsCdc42与斑马鱼、青鳉、虹鳟、大菱鲆和虾等氨基酸序列同源性分别为99.43％、97.91％、95.81％、94.76％和91.10％;构建系统发育树显示CsCdc42与斑马鱼、人和海水鱼类Cdc42亲缘关系最近,自然聚为一支.以上结果为研究半滑舌鳎细胞分裂周期蛋白相关基因功能提供科学参考.
文献关键词：
半滑舌鳎;细胞分裂周期蛋白42;基因克隆;结构预测
中图分类号：
作者姓名：
刘厚孚;谭静;胡秀彩;管振国;吕爱军;孙敬锋
作者机构：
天津农学院 水产学院 天津市水产生态及养殖重点实验室,天津 300392;天津鼎正新兴生物技术有限公司,天津 300383
文献出处：
引用格式：
[1]刘厚孚;谭静;胡秀彩;管振国;吕爱军;孙敬锋-.半滑舌鳎细胞分裂周期蛋白42基因克隆与结构预测)[J].天津农学院学报,2022(03):36-42
A类：
CsCdc42
B类：
半滑舌鳎,细胞分裂,基因克隆,结构预测,Rho,超家族,亚类,细胞骨架,肌动蛋白,特异性引物,生物信息学方法,段长度,bp,抗原表位,aa,RHO,结构域,ATP,GTP,结合位点,酰基化,蛋白结构,折叠,无规则,卷曲,序列比对,斑马鱼,青鳉,虹鳟,大菱鲆,氨基酸序列,序列同源性,建系,系统发育树,海水鱼类,亲缘关系,白相,基因功能
AB值：
0.343249
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