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典型文献
侵染早期小麦叶锈菌相关基因的筛选及表达分析
文献摘要:
为挖掘与叶锈菌萌发及早期侵染相关的关键基因,利用PacBio SMRT和Illumina HiSeq测序技术对叶锈菌夏孢子萌发0、2、4、8、12和24 h的孢子和芽管进行转录组测序,通过全长转录本基因表达差异分析和生物信息学分析进行候选基因筛选,利用qRT-PCR技术对候选基因在不同毒力菌系与小麦的亲和/非亲和互作中的表达模式进行系统分析.结果表明:1)综合分析筛选出差异显著且功能相关的4个候选基因,其中,PTTG_1050为SNARE蛋白的编码基因,可能参与SNARE介导的囊泡运输;PTTG_4765属于ABC转运蛋白基因家族PDR亚族;PTTG_1823属于PKc_Like超基因家族;PTTG_1279为候选分泌蛋白编码基因.2)4个候选基因在侵染早期受到强烈诱导或抑制,且在亲和互作中表达量高于非亲和互作,说明其在叶锈菌的早期侵染和扩展中发挥了重要作用,可能是早期成功侵染的关键基因.
文献关键词:
小麦叶锈菌;转录组测序;夏孢子萌发;早期互作;qRT-PCR;致病基因
作者姓名:
张艺博;路亚南;刘娜;肖继斌;李闯;程琨;邢国珍;马振玲;郑文明
作者机构:
河南农业大学生命科学学院/小麦玉米作物学国家重点实验室,郑州450002
引用格式:
[1]张艺博;路亚南;刘娜;肖继斌;李闯;程琨;邢国珍;马振玲;郑文明-.侵染早期小麦叶锈菌相关基因的筛选及表达分析)[J].中国农业大学学报,2022(10):22-32
A类:
夏孢子萌发,PKc,早期互作
B类:
侵染,小麦叶锈菌,菌相,表达分析,关键基因,PacBio,SMRT,Illumina,HiSeq,转录组测序,全长,转录本,基因表达差异,生物信息学分析,候选基因筛选,qRT,毒力,表达模式,出差,PTTG,SNARE,编码基因,囊泡运输,ABC,转运蛋白,基因家族,PDR,Like,超基因,分泌蛋白,蛋白编码,致病基因
AB值:
0.295159
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