典型文献
不同蛋白含量大豆籽粒的转录组分析及蛋白合成相关基因预测
文献摘要：
[目的]筛选大豆蛋白合成相关转录因子,预测蛋白合成候选基因和代谢通路.[方法]以低蛋白大豆材料中豆4901和高蛋白大豆材料淮豆98-28为研究对象,采用RNA-Seq技术,对不同蛋白含量的大豆籽粒进行高通量测序.[结果]获取到43.14 Gb Clean Data,每个样品数据量都在6.46 Gb以上,GC含量在45.73％以上,Q20碱基百分比在94.78％以上,Q30碱基百分比在88.53％以上,数据质量符合要求.获得差异表达基因的总数为916个,其中,上调的差异基因有248个、下调的差异基因有668个.筛选出差异的转录因子属于26个转录因子家族,可能参与大豆蛋白合成的转录因子家族有4个,分别为b HLH、AP2/ERF、MYB、B3.[结论]大豆蛋白的内质网加工途径中蛋白传导通道的Sec61基因发生下调,导致蛋白合成能力下降,品种蛋白含量降低,推测Sec61基因是蛋白合成的关键基因.造成品种间蛋白差异的相关代谢途径与蛋白内质网加工、硫代谢、谷胱甘肽代谢等通路紧密相关.
文献关键词：
大豆;蛋白含量;转录组测序
中图分类号：
作者姓名：
张黎杰;刘书华;周玲玲
作者机构：
江苏省农业科学院宿迁农科所,江苏宿迁 223800
文献出处：
引用格式：
[1]张黎杰;刘书华;周玲玲-.不同蛋白含量大豆籽粒的转录组分析及蛋白合成相关基因预测)[J].北方农业学报,2022(04):1-10
A类：
Sec61
B类：
蛋白含量,籽粒,转录组分析,蛋白合成,大豆蛋白,候选基因,代谢通路,低蛋白,高蛋白大豆,Seq,取到,Gb,Clean,Data,品数,数据量,Q20,碱基,Q30,数据质量,符合要求,差异表达基因,差异基因,出差,HLH,AP2,ERF,MYB,B3,内质网,加工途径,导通,生下,合成能力,种蛋,含量降低,关键基因,种间,代谢途径,硫代谢,谷胱甘肽代谢,转录组测序
AB值：
0.397231
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