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肠道病毒68型分离株VP1区序列分子进化研究
文献摘要：
目的 探索肠道病毒68型(Enterovirus D68,EV-D68)分离株VP1区序列分子流行病学特征和毒株遗传进化规律.方法 应用生物信息学软件,分析EV-D68分离株密码子偏爱性、选择压力位点和氨基酸置换熵值.结果 EV-D68分离株VP1区序列ENC均值为46.27,密码子偏爱A/U结尾,ENC-Plot绘图、中性绘图和奇偶规则绘图等分析显示自然选择是影响密码子使用模式的主要因素.发现2个正向选择位点和5个氨基酸易突变位点.结论 EV-D68分离株密码子偏爱性较弱,毒株进化整体处于负选择压力下,以自身进化为主,受自然选择压力影响.
文献关键词：
肠道病毒68型;密码子偏爱性;选择压力
中图分类号：
作者姓名：
卢正祥;姚学君;陈国清;李峰;管书慧;张红军
作者机构：
盐城市亭湖区疾病预防控制中心,江苏盐城224100;盐城市疾病预防控制中心
文献出处：
引用格式：
[1]卢正祥;姚学君;陈国清;李峰;管书慧;张红军-.肠道病毒68型分离株VP1区序列分子进化研究)[J].江苏预防医学,2022(04):375-378
A类：
密码子偏爱性
B类：
肠道病毒,分离株,VP1,分子进化,Enterovirus,D68,EV,分子流行病学,流行病学特征,毒株,遗传进化,进化规律,生物信息学软件,选择压力,ENC,结尾,Plot,绘图,奇偶,自然选择,使用模式,正向选择位点,突变位点
AB值：
0.277309
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