典型文献
2020年安徽省1株候鸟源H5N8禽流感病毒遗传进化特征分析
文献摘要:
目的 分析安徽省肥东县候鸟监测站检测的H5N8亚型禽流感病毒(AIVs)的遗传进化特征.方法 从收集的死亡天鹅样本中提取病毒RNA,使用实时荧光定量RT-PCR区分流感亚型,并采用一代测序方法对阳性样本的HA和NA基因扩增后测序,应用生物信息学软件构建系统发育进化树并分析其分子特征.结果 2020年12月1日收到来自安徽省肥东县1只死亡天鹅的鼻拭子、鸟喙拭子和泄殖腔拭子样本,PCR结果均显示H5阳性,测序结果提示3份样本为同一株H5N8亚型禽流感病毒.遗传进化分析显示,该病毒属于2.3.4.4支系且与埃及、俄罗斯等地分离株有很高的相似性,其HA与NA基因都在欧亚谱系中,并且已经适应了不同宿主.该病毒HA裂解位点呈现高致病性分子特征,存在6个糖基化位点,且发生S133L、S137A、T160A、D187N、K193N、Q196K、S227R氨基酸突变.PB2蛋白发生K389R、V589T突变、PA蛋白发生N409S突变、M1蛋白发生N30D、T215A突变、NS1蛋白发生P42S突变.结论 本次发现的H5N8亚型禽流感病毒受体结合位点仍为禽源受体,但具有人源受体分子特征,其他氨基酸位点都提示该病毒有毒力增强的危险性,需进一步加强监测.
文献关键词:
H5N8;禽流感;遗传特征;分子特征
中图分类号:
作者姓名:
黄鑫儿;周雪;侯赛;侯银续;俞俊岭;陈晴晴;祝茜;何兰;龚磊;吴家兵;何军
作者机构:
安徽医科大学公共卫生学院,安徽合肥230032;安徽省疾病预防控制中心,安徽省公共卫生研究院,安徽合肥230601
文献出处:
引用格式:
[1]黄鑫儿;周雪;侯赛;侯银续;俞俊岭;陈晴晴;祝茜;何兰;龚磊;吴家兵;何军-.2020年安徽省1株候鸟源H5N8禽流感病毒遗传进化特征分析)[J].疾病监测,2022(01):115-122
A类:
S133L,S137A,T160A,D187N,K193N,Q196K,S227R,K389R,V589T,N409S,N30D,T215A,P42S
B类:
候鸟,H5N8,禽流感病毒,进化特征,肥东县,监测站,AIVs,天鹅,一代测序,阳性样本,HA,基因扩增,后测,生物信息学软件,软件构建,建系,系统发育进化树,分子特征,鼻拭子,泄殖腔,子样本,一株,遗传进化分析,支系,埃及,分离株,欧亚,不同宿主,高致病性,糖基化位点,氨基酸突变,PB2,白发,PA,M1,NS1,病毒受体,结合位点,氨基酸位点,有毒,毒力,遗传特征
AB值:
0.272955
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