典型文献
大鳍鳠GHR基因CDS区克隆及生物信息学分析
文献摘要：
该研究利用cDNA末端快速扩增(RACE)技术成功克隆到大鳍鳠的GHR基因,获得了其完整的CDS区序列;通过同源序列比对构建了大鳍鳠的系统进化树,并采用生物信息学的方法分析了大鳍鳗GHR蛋白的特性.结果表明:大鳍鳠GHR基因CDS区长度为1 731 bp,编码576个氨基酸;大鳍鳠与黄颡鱼、斑点叉尾鮰的亲缘关系较近,它们之间GHR基因的同源性分别为90.3％、88.7％,但是与哺乳动物的亲缘关系较远;大鳍鳠GHR蛋白分子式为C2900H4483N765O888S28,属于跨膜蛋白,其二级结构由α-螺旋(20.66％)、延伸链(24.13％)和无规则卷曲(55.21％)组成,三级结构预测结果与二级结构一致;该蛋白能与GH1、GH2、CISH、JAK2和STAT5A等分子形成互作网络.
文献关键词：
大鳍鳠;GHR基因;克隆;生物信息学分析
中图分类号：
作者姓名：
葛玲瑞;刘科均;张建国
作者机构：
湖南生物机电职业技术学院,湖南长沙410127
文献出处：
引用格式：
[1]葛玲瑞;刘科均;张建国-.大鳍鳠GHR基因CDS区克隆及生物信息学分析)[J].湖南农业科学,2022(05):7-11,17
A类：
大鳍鳗,C2900H4483N765O888S28,GH2
B类：
大鳍鳠,GHR,CDS,生物信息学分析,研究利用,cDNA,RACE,序列比对,系统进化树,区长,bp,黄颡鱼,斑点叉尾鮰,亲缘关系,同源性,哺乳动物,较远,分子式,跨膜蛋白,二级结构,无规则,卷曲,三级结构,结构预测,GH1,CISH,JAK2,STAT5A,互作网络
AB值：
0.354261
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