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典型文献
基于网络药理学及分子对接技术探讨四逆散治疗勃起功能障碍的作用机制
文献摘要:
目的:基于网络药理学和分子对接技术探讨四逆散治疗勃起功能障碍(erectile dysfunction,ED)的作用机制.方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)检索四逆散组方中药的活性成分及作用靶点,并运用Cytoscape3.9.1软件可视化"四逆散-活性成分-靶点"网络图.利用治疗靶标数据库(therapeutic target database,TTD)、人类基因数据库(GeneCards ?:the human gene database)、在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)、DisGeNET数据库筛选疾病相 关靶点.通过Venny2.1.0将药物活性成分靶点与ED相关靶点进行映射,取交集,即为四逆散治疗ED的潜在靶点.将交集靶点与对应药物活性成分导入Cytoscape3.9.1软件,构建"四逆散-活性成分-潜在靶点-疾病"网络图并进行拓扑分析.将潜在靶点导入STRING数据库构建蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,利用CytoNCA进行分析筛选核心靶点,并构建核心靶点PPI网络.采用Metascape数据库对核心靶点进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路富集分析.采用AutoDock对活性成分和核心靶点进行分子对接,并使用Pymol软件可视化对接结果.结果:利用TCMSP获得柴胡、枳实、白芍、甘草活性成分共120个及相关靶点249个.通过GeneCards、OMIM、TTD、DisGeNET数据库检索得到1 846个ED疾病靶点,与活性成分相关靶点取交集后获得156个四逆散治疗ED的潜在靶点."四逆散-活性成分-潜在靶点-疾病"网络拓扑分析筛选出排名前5位的活性成分分别是槲皮素、木犀草素、山柰酚、芒柄花素及7-甲氧基-2-甲基异黄酮.PPI网络拓扑分析筛选出丝裂原活化蛋白激酶3(mitogen-activated protein kinase 3,MAPK3)、信号转导和转录激活因子3(signal trans-ducer and activator of transcription 3,STAT3)、转录因子 AP-1(AP-1 transcription factor subunit,JUN)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(serine/threonine protein kinase 1,AKT1)、肿瘤抗原 p53(tumor protein p53,TP53)等 23 个核心靶点.核心靶点 GO 功能富集分析得到719个生物过程、18个细胞组分及41个分子功能;KEGG信号通路富集分析得到149条信号通路.分子对接发现,四逆散活性成分与核心靶点对接良好,其中木犀草素与TP53结合能最低.结论:四逆散通过多成分、多靶点、多通路发挥改善ED的作用.
文献关键词:
勃起功能障碍;四逆散;网络药理学;分子对接;《伤寒论》;张仲景
作者姓名:
蔚文垚;曹继刚;邓超;姜兴宇;任方楠
作者机构:
湖北中医药大学,湖北武汉 430061
文献出处:
引用格式:
[1]蔚文垚;曹继刚;邓超;姜兴宇;任方楠-.基于网络药理学及分子对接技术探讨四逆散治疗勃起功能障碍的作用机制)[J].河南中医,2022(10):1492-1500
A类:
B类:
网络药理学,分子对接技术,技术探讨,四逆散,勃起功能障碍,erectile,dysfunction,ED,系统药理学,分析平台,traditional,Chinese,medicine,systems,pharmacology,database,analysis,platform,TCMSP,组方,作用靶点,Cytoscape3,网络图,靶标,therapeutic,target,TTD,人类基因,基因数据库,GeneCards,human,线人,孟德尔遗传,online,mendelian,inheritance,OMIM,DisGeNET,Venny2,药物活性成分,活性成分靶点,即为,潜在靶点,交集靶点,STRING,数据库构建,蛋白质相互作用,protein,interaction,PPI,CytoNCA,核心靶点,Metascape,基因本体,ontology,功能富集分析,京都基因与基因组百科全书,kyoto,encyclopedia,genes,genomes,信号通路富集,通路富集分析,AutoDock,Pymol,柴胡,枳实,白芍,甘草,数据库检索,网络拓扑分析,槲皮素,木犀草素,山柰酚,芒柄花素,甲氧基,异黄酮,丝裂原活化蛋白激酶,mitogen,activated,kinase,MAPK3,信号转导和转录激活因子,signal,ducer,activator,transcription,STAT3,subunit,JUN,丝氨酸,苏氨酸蛋白激酶,serine,threonine,AKT1,肿瘤抗原,p53,tumor,TP53,生物过程,接发,结合能,多成分,多靶点,多通路,伤寒论,张仲景
AB值:
0.374994
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