典型文献
基于网络药理学和分子对接探讨黄药子-夏枯草-五味子治疗亚急性甲状腺炎的作用机制
文献摘要:
目的:基于网络药理学和分子对接技术探讨黄药子-夏枯草-五味子治疗亚急性甲状腺炎(subacute thyroiditis,SAT)的作用机制.方法:基于中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology data-base and analysis platform,TCMSP)筛选黄药子-夏枯草-五味子的有效成分及作用靶点;利用人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)、人类基因数据库(GeneCards)及 DrugBank 获取 SAT 相关靶点;运用 venny 2.1.0软件取黄药子-夏枯草-五味子有效成分相关靶点与SAT疾病靶点的交集,即为黄药子-夏枯草-五味子治疗SAT的潜在作用靶点;在STRING数据库中获得潜在靶点蛋白相互作用关系,使用Cytoscape 3.7.2进行可视化,并进行拓扑分析筛选黄药子-夏枯草-五味子治疗SAT的关键靶点;通过Metascape数据库对潜在靶点进行基因本体(gene ontol-ogy,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,并利用Cytoscape 3.7.2构建"关键成分-潜在靶点-通路-疾病"网络;选取度值排名前3位的关键靶点和有效成分作为受体蛋白和配体小分子,使用AutoDockTools 1.5.6对配体和受体进行分子对接,并使用Pymol将分子对接结果可视化.结果:共筛选到28个有效成分及220个有效成分相关靶点;获得SAT相关靶点826个,潜在作用靶点103个;拓扑分析发现19种关键成分和42个潜在关键靶点;GO富集分析筛选出6 448个条目,涉及生物过程5 374个,细胞组成407个,分子功能667个;KEGG通路富集分析得到438条通路;分子对接发现受体与配体之间结合良好.结论:黄药子-夏枯草-五味子可能通过多成分、多靶点调节肿瘤坏死因子信号通路、丝裂原活化蛋白激酶信号通路、甲状腺激素信号通路等发挥治疗亚急性甲状腺炎的作用.
文献关键词:
亚急性甲状腺炎;黄药子;夏枯草;五味子;网络药理学;分子对接;作用机制
中图分类号:
作者姓名:
贾慧雨;吕娜;冯志海
作者机构:
河南中医药大学,河南郑州 450046;河南省中医药研究院附属医院,河南郑州 450000;河南中医药大学第一附属医院,河南郑州 450001
文献出处:
引用格式:
[1]贾慧雨;吕娜;冯志海-.基于网络药理学和分子对接探讨黄药子-夏枯草-五味子治疗亚急性甲状腺炎的作用机制)[J].河南中医,2022(08):1199-1205
A类:
ontol
B类:
网络药理学,黄药子,夏枯草,五味子,亚急性甲状腺炎,分子对接技术,技术探讨,subacute,thyroiditis,SAT,系统药理学,分析平台,traditional,Chinese,medicine,systems,pharmacology,data,base,analysis,platform,TCMSP,有效成分,作用靶点,孟德尔遗传,online,mendelian,inheritance,man,OMIM,人类基因,基因数据库,GeneCards,DrugBank,venny,交集,即为,潜在作用,STRING,潜在靶点,靶点蛋白,蛋白相互作用,相互作用关系,Cytoscape,拓扑分析,关键靶点,Metascape,基因本体,功能富集分析,京都基因与基因组百科全书,kyoto,encyclopedia,genes,genomes,通路富集分析,关键成分,分作,受体蛋白,小分子,AutoDockTools,Pymol,条目,生物过程,细胞组成,接发,多成分,多靶点,肿瘤坏死因子信号通路,丝裂原活化蛋白激酶信号通路,甲状腺激素信号通路
AB值:
0.296845
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