典型文献
基于网络药理学探讨黄芪治疗慢性肾脏病的分子机制
文献摘要:
目的:基于网络药理学探讨黄芪治疗慢性肾脏病(chronic kidney disease,CKD)的分子机制.方法:基于中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)检索黄芪的有效成分及其相关靶点;在GeneCards、DrugBank Online数据库中检索CKD相关靶点,与黄芪活性成分相关靶点进行映射,交集靶点即为黄芪治疗CKD的潜在靶点;将黄芪治疗CKD的潜在靶点导入String数据库绘制蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,并采用CytoScape 3.9.1软件进行拓扑分析,筛选出黄芪治疗CKD的核心靶点;利用Metascape数据库对黄芪治疗CKD的核心靶点进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路富集分析;利用CytoScape 3.9.1软件构建"黄芪-活性成分-潜在靶点-信号通路-疾病"网络图.结果:基于TCMSP检索到黄芪有效成分20个及相关靶点204个;检索GeneCards、DrugBank Online数据库得出CKD相关靶点1 266个,将黄芪活性成分相关靶点与CKD对应靶点导入Venny 2.1.0,得到黄芪治疗CKD的潜在靶点104个;PPI网络拓扑分析筛选出53个黄芪治疗CKD的核心靶点;KEGG信号通路富集分析获得32条信号通路,GO功能富集分析得到生物过程、细胞组分及分子功能各104个.结论:黄芪可通过多成分、多靶点、多通路治疗慢性肾脏病.
文献关键词:
慢性肾脏病;黄芪;网络药理学;分子机制
中图分类号:
作者姓名:
张宝霞;陈小飞;陈文佳;丁海波;饶克瑯;章小稳
作者机构:
新余市中医院,江西新余 338000;深圳市宝安区中医院,广东深圳 518133
文献出处:
引用格式:
[1]张宝霞;陈小飞;陈文佳;丁海波;饶克瑯;章小稳-.基于网络药理学探讨黄芪治疗慢性肾脏病的分子机制)[J].河南中医,2022(11):1683-1688
A类:
B类:
网络药理学,黄芪,慢性肾脏病,chronic,kidney,disease,CKD,系统药理学,分析平台,traditional,Chinese,medicine,systems,pharmacology,database,analysis,platform,TCMSP,有效成分,GeneCards,DrugBank,Online,活性成分,交集靶点,即为,潜在靶点,String,蛋白质相互作用,protein,interaction,PPI,CytoScape,核心靶点,Metascape,基因本体,ontology,功能富集分析,京都基因与基因组百科全书,kyoto,encyclopedia,genes,genomes,信号通路富集,通路富集分析,软件构建,网络图,Venny,网络拓扑分析,生物过程,多成分,多靶点,多通路
AB值:
0.306408
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