典型文献
基于网络药理学及分子对接技术探讨半夏泻心汤治疗胃食管反流病的作用机制
文献摘要:
目的:基于网络药理学及分子对接技术探讨半夏泻心汤治疗胃食管反流病(gastroesophageal reflux disease,GERD)的作用机制.方法:基于中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)检索半夏泻心汤组方中药活性成分,并通过Swiss Target Prediction 数据库筛选活性成分相关作用靶点.在DisGeNET 数据库、在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)和GeneCards数据库中检索疾病相关靶点及潜在作用靶点.将潜在作用靶点与其对应的活性成分导入Cytoscape 3.9.0 软件构建"半夏泻心汤-活性成分-靶点"网络并进行拓扑分析筛选核心活性成分,构建蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,拓扑分析筛选关键靶点,并构建关键靶点的PPI 网络筛选核心靶点.将关键靶点导入DAVID 数据库进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路富集分析.运用Autodock Vina 软件将核心活性成分与核心靶点进行对接.结果:共获得140 个中药活性成分、1 111 个相关靶点及4 176 个疾病相关靶点.将活性成分相关靶点与GERD 靶点进行映射,得到412 个半夏泻心汤治疗GERD 的潜在作用靶点."半夏泻心汤-活性成分-靶点"网络拓扑分析发现槲皮素、β-谷甾醇、黄芩素、山柰酚、豆甾醇、表小檗碱等是半夏泻心汤治疗GERD 的核心活性成分.将潜在靶点导入STRING 数据库构建PPI 网络,拓扑分析得到42 个关键靶点,关键靶点PPI 网络分析发现,信号转导和转录激活因子3(signal transducer and activator of transcription 3,STAT3)、肿瘤蛋白p53(tumor protein p53,TP53)、热休克蛋白90AA1(heat shock proteins 90AA1,HSP90AA1)等为半夏泻心汤治疗GERD 的核心靶点.GO 功能富集分析共得到515 个生物学过程条目、63 个细胞组分条目及93 个分子功能条目,KEGG 信号通路富集分析筛选得到150 条信号通路.分子对接显示,核心成分与核心靶点结合稳定.结论:半夏泻心汤中槲皮素、β-谷甾醇、豆甾醇等多种活性成分通过调控STAT3、TP53、HSP90AA1 等多靶点参与肿瘤相关通路、人类巨细胞病毒感染等多条通路治疗GERD.
文献关键词:
胃食管反流病;半夏泻心汤;作用机制;网络药理学;分子对接;《伤寒论》;张仲景
中图分类号:
作者姓名:
罗安;胡佳
作者机构:
江西中医药大学附属医院,江西南昌 330006
文献出处:
引用格式:
[1]罗安;胡佳-.基于网络药理学及分子对接技术探讨半夏泻心汤治疗胃食管反流病的作用机制)[J].河南中医,2022(12):1800-1807
A类:
B类:
网络药理学,分子对接技术,技术探讨,半夏泻心汤,胃食管反流病,gastroesophageal,reflux,disease,GERD,系统药理学,分析平台,traditional,Chinese,medicine,systems,pharmacology,database,analysis,platform,TCMSP,组方,中药活性成分,Swiss,Target,Prediction,作用靶点,DisGeNET,线人,孟德尔遗传,online,mendelian,inheritance,man,OMIM,GeneCards,疾病相关,潜在作用,Cytoscape,软件构建,蛋白质相互作用,interaction,PPI,选关,关键靶点,核心靶点,DAVID,基因本体,ontology,功能富集分析,京都基因与基因组百科全书,kyoto,encyclopedia,genes,genomes,信号通路富集,通路富集分析,Autodock,Vina,共获,网络拓扑分析,槲皮素,谷甾醇,黄芩素,山柰酚,豆甾醇,表小檗碱,潜在靶点,STRING,数据库构建,信号转导和转录激活因子,signal,transducer,activator,transcription,STAT3,p53,tumor,TP53,热休克蛋白,heat,shock,proteins,HSP90AA1,生物学过程,条目,选得,核心成分,多靶点,点参,肿瘤相关,相关通路,人类巨细胞病毒,巨细胞病毒感染,多条,伤寒论,张仲景
AB值:
0.331943
机标中图分类号,由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成,仅供学习研究参考。