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典型文献
基于网络药理学探讨四神煎治疗类风湿关节炎的作用机制
文献摘要:
目的:基于网络药理学探讨四神煎治疗类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)的作用机制.方法:通过中药系统药理数据库和分析平台(traditional chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)、中医药百科全书数据库(encyclopedia of traditional chinese medicine,ETCM)检索四神煎组方中药的主要化学成分,并结合文献进行筛选、补充;通过Pubchem有机小分子生物活性数据库检索化学成分的SMILES结构式及2D结构,经Swiss ADME数据库筛选后将符合标准的化学成分上传至Swiss Target Prediction数据库预测药物活性靶点;通过人类基因数据库(Gencards)、在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)、治疗靶标数据库(therapeutic target database,TTD)、DrugBank数据库获取RA疾病相关靶点;绘制韦恩图并获取四神煎活性成分与RA的共同靶点;基于String平台构建药物疾病共同靶点的蛋白互作网络;基于Metascape平台进行基因本体(gene ontology,GO)生物功能分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析;采用Cytoscape 3.7.1软件构建"成分-靶点-通路"网络,应用网络分析仪(network analyzer)功能获得各成分、靶点的网络拓扑参数,筛选四神煎发挥治疗RA作用的重要活性成分及核心靶点.结果:通过ETCM、TCMSP数据库结合文献检索获得60个四神煎活性成分及353个相关靶点;通过GeneCards、OMIM、TTD、DrugBank四个数据库获得1 277个RA潜在靶点;将药物成分作用靶点与RA相关靶点映射后,得到四神煎治疗RA的靶点151个;GO生物功能富集分析得到2 322个条目,其中生物过程2 089条,细胞组分79条,分子功能154条;KEGG通路富集分析获得174个信号通路,主要涉及白细胞介素-17(interleukin-17,IL-17)信号通路、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)信号通路、Th17细胞分化、破骨细胞分化、核因子-KB(nu-clear factor-kappa B,NF-KB)信号通路等;网络拓扑分析得出四神煎发挥治疗RA作用的重要活性成分有槲皮素、木犀草素、山柰酚、汉黄芩素等化合物,重要靶点基因主要有PTGS2、PTGS1、RELA、TNF、NFKB1、IL-6等.结论:四神煎可能通过槲皮素、木犀草素、山柰酚、汉黄芩素等活性成分调控PTGS2、PTGS1、RELA、TNF、NFKB1、IL-6等靶点基因的表达,进而调控IL-17信号通路、TNF信号通路、Th17细胞分化、破骨细胞分化等生物学通路发挥治疗RA的作用.
文献关键词:
四神煎;类风湿关节炎;网络药理学;作用机制
作者姓名:
付静思;姜泉;夏聪敏;但文超;巩勋;岳铭;唐晓颇
作者机构:
中国中医科学院广安门医院,北京100053;北京中医药大学,北京100029
文献出处:
引用格式:
[1]付静思;姜泉;夏聪敏;但文超;巩勋;岳铭;唐晓颇-.基于网络药理学探讨四神煎治疗类风湿关节炎的作用机制)[J].中医学报,2022(01):156-164
A类:
B类:
网络药理学,四神煎,类风湿关节炎,rheumatoid,arthritis,RA,分析平台,traditional,chinese,medicine,systems,pharmacology,database,analysis,platform,TCMSP,encyclopedia,ETCM,组方,主要化学成分,Pubchem,有机小分子,数据库检索,SMILES,结构式,2D,Swiss,ADME,符合标准,Target,Prediction,药物活性,人类基因,基因数据库,Gencards,线人,孟德尔遗传,online,mendelian,inheritance,man,OMIM,靶标,therapeutic,target,TTD,DrugBank,疾病相关,韦恩图,活性成分,String,平台构建,蛋白互作网络,Metascape,基因本体,ontology,生物功能,功能分析,京都基因与基因组百科全书,kyoto,genes,genomes,通路富集分析,Cytoscape,软件构建,网络分析仪,network,analyzer,网络拓扑参数,核心靶点,文献检索,GeneCards,潜在靶点,药物成分,成分作用,作用靶点,功能富集分析,条目,生物过程,interleukin,tumor,necrosis,Th17,破骨细胞分化,核因子,nu,clear,kappa,网络拓扑分析,槲皮素,木犀草素,山柰酚,汉黄芩素,靶点基因,PTGS2,PTGS1,RELA,NFKB1,成分调控,生物学通路
AB值:
0.363705
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