典型文献
基于网络药理学和分子对接技术探索丹参治疗习惯性流产潜在作用机制
文献摘要:
目的:基于网络药理学及分子对接技术探究丹参治疗习惯性流产的作用机制.方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)及文献检索获得丹参活性成分.依托TCMSP以及Swiss Target Prediction数据库预测活性成分的作用靶点,人类基因数据库(Genecards)和人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)检索习惯性流产的疾病靶点,进而获得丹参治疗习惯性流产的交集靶点.通过Cytoscape 3.6.0软件构建中药-活性成分-靶点-疾病网络图;通过STING数据库进行蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)分析,运用DAVID 6.8数据库进行相关靶点的基因本体(gene ontology,GO)富集分析、京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析.利用Ledock软件对丹参活性成分及其关键靶点进行分子对接验证.结果:丹参筛选获得74个活性成分.活性成分作用靶点774个,疾病相关靶点1 956个,两者交集靶点共303个.PPI分析显示TP53、CDK1、AKT1、STAT3及CDKN1A蛋白在丹参治疗习惯性流产中起主要作用.GO富集分析结果表明丹参-习惯性流产交集基因的细胞组分为质膜、细胞溶质、细胞外间隙、核质等,分子功能涉及酶结合活性、蛋白质结合活性、ATP结合活性等,而生物过程包含细胞增殖的正调控、炎症反应、蛋白质磷酸化等.KEGG通路分析结果显示,丹参治疗习惯性流产主要包括癌症通路、PI3K-Akt信号通路、癌症的蛋白多糖通路、Rap1信号通路.结论:丹参治疗习惯性流产具有多成分、多靶点、多通路的治疗作用特点.
文献关键词:
丹参;习惯性流产;网络药理学;分子对接法;肾虚血瘀证
中图分类号:
作者姓名:
康宁;段晨晨;张清燕;岳静宇;刘银姣;李强
作者机构:
河南中医药大学第一附属医院,河南郑州450000;洛阳市中医院,河南洛阳471000;河南省病毒性疾病中医药防治重点实验室,河南郑州450000
文献出处:
引用格式:
[1]康宁;段晨晨;张清燕;岳静宇;刘银姣;李强-.基于网络药理学和分子对接技术探索丹参治疗习惯性流产潜在作用机制)[J].中医学报,2022(08):1711-1718
A类:
B类:
网络药理学,分子对接技术,技术探索,丹参,习惯性流产,潜在作用,技术探究,系统药理学,分析平台,traditional,Chinese,medicine,systems,pharmacology,database,analysis,platform,TCMSP,文献检索,活性成分,Swiss,Target,Prediction,作用靶点,人类基因,基因数据库,Genecards,孟德尔遗传,online,mendelian,inheritance,man,OMIM,交集靶点,Cytoscape,软件构建,网络图,STING,蛋白质相互作用,protein,interaction,PPI,DAVID,基因本体,ontology,京都基因与基因组百科全书,Kyoto,encyclopedia,genes,genomes,通路富集分析,Ledock,关键靶点,成分作用,疾病相关,TP53,CDK1,AKT1,STAT3,CDKN1A,质膜,溶质,细胞外间隙,核质,结合活性,蛋白质结合,ATP,生物过程,正调控,蛋白质磷酸化,通路分析,癌症通路,PI3K,Akt,蛋白多糖通路,Rap1,多成分,多靶点,多通路,治疗作用,作用特点,分子对接法,肾虚血瘀证
AB值:
0.391191
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