典型文献
静电场轨道阱质谱法测定人泪液蛋白研究
文献摘要：
目的 采用纳升液相色谱-四极杆-静电场轨道阱质谱法检测人泪液蛋白,并对主要蛋白质进行生物信息学分析.方法 通过毛细管虹吸收集成人泪液样品于3k Da超滤管,400μL超纯水,12 000×g离心15 min,重复4次提取泪液蛋白,经胰蛋白酶消化后,经Waters NanoAcquity peptide BEH C18色谱柱(1.7μm,100 μm×100 mm)分离,纳升液相色谱-四极杆-静电场轨道阱质谱检测,以0.1％甲酸水溶液和乙腈(0.1％甲酸)为流动相,电喷雾正离子模式电离,Full MS/dd-MS2监测模式测定,采用Proteome Discoverer 2.1软件检索Uniprot蛋白质数据库鉴定蛋白质种类,采用牛血清白蛋白进行方法学验证.基于String数据库对泪液蛋白进行基因注解分析.结果 获得人泪液蛋白(387±16)种,相对标准偏差为4.13％,其中脂质运载蛋白1、溶菌酶和乳铁蛋白等25种蛋白的相对丰度较高.牛血清白蛋白肽段覆盖率为(86.08±2.61)％,相对标准偏差为3.03％.25种主要泪液蛋白参与多细胞间物质传导、稳态过程、内肽酶活性的负调控、化学刺激物的检测和体液免疫反应等作用,其中16种蛋白相互作用紧密,相对丰度较高的催泪蛋白、脂质运载蛋白1、乳铁蛋白、溶菌酶和锌α2糖蛋白具有较多的连接.结论 纳升液相色谱-四极杆-静电场轨道阱质谱法稳定可靠,适用于泪液中多种蛋白质的检测.
文献关键词：
静电场轨道阱质谱;泪液;超滤管;蛋白组学
中图分类号：
作者姓名：
潘晓东;邵潘驰;周亚南;陈苘;韩见龙
作者机构：
浙江省疾病预防控制中心理化与毒理检验所,浙江杭州310051;浙江中医药大学,浙江杭州310051
文献出处：
引用格式：
[1]潘晓东;邵潘驰;周亚南;陈苘;韩见龙-.静电场轨道阱质谱法测定人泪液蛋白研究)[J].预防医学,2022(06):644-648
A类：
NanoAcquity,白蛋白肽
B类：
静电场轨道阱质谱,质谱法,定人,泪液蛋白,四极,生物信息学分析,毛细管,虹吸,3k,Da,超滤管,超纯水,胰蛋白酶,酶消化,Waters,peptide,BEH,C18,色谱柱,质谱检测,水溶液,乙腈,流动相,电喷雾,正离子模式,电离,Full,dd,MS2,监测模式,Proteome,Discoverer,Uniprot,蛋白质数据库,牛血清白蛋白,方法学验证,String,注解,相对标准偏差,脂质运载蛋白,溶菌酶,乳铁蛋白,种蛋,相对丰度,白参,多细胞,稳态过程,内肽酶,负调控,刺激物,体液免疫,免疫反应,蛋白相互作用,催泪,糖蛋白,蛋白组学
AB值：
0.311257
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