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基质辅助激光解析电离飞行时间质谱法对2020年天津市生畜肉中产气荚膜梭菌的快速鉴定及聚类分析
文献摘要:
目的 探索基质辅助激光解析电离飞行时间质谱法(MALDI-TOF MS)对生畜肉中产气荚膜梭菌的快速鉴定效果及溯源可行性.方法 将RT-PCR法鉴定为C.perfringens的19株分离株和1株标准菌株(CICC22949)进行MALDI-TOF MS检测.经MBT Compass软件鉴定分析获取相应特征蛋白质指纹图谱,经MBT Compass Explorer软件分析建立命名为C.perfringens的自建数据库并进行聚类分析,采用标准菌株CICC22949等菌株进行验证.结果 C.perfringens自建数据库对C.perfringens的鉴定结果较原自带数据库明显提高,所有菌株鉴定分值均达到2.000之上.对18株C.perfringens进行聚类分析发现,X区和K区样本污染来源单一,J区样本具有多个污染源.结论 自建细菌数据库,对细菌进行聚类分析,可提高MALDI-TOF MS对本地菌株的鉴定能力,并实现对菌株的溯源.
文献关键词:
产气荚膜梭菌;基质辅助激光解析电离飞行时间质谱法;鉴定;聚类分析
作者姓名:
盛楠
作者机构:
天津市武清区疾病预防控制中心,天津301700
引用格式:
[1]盛楠-.基质辅助激光解析电离飞行时间质谱法对2020年天津市生畜肉中产气荚膜梭菌的快速鉴定及聚类分析)[J].预防医学情报杂志,2022(12):1592-1596
A类:
CICC22949
B类:
基质辅助激光解析电离飞行时间质谱法,畜肉,产气荚膜梭菌,快速鉴定,MALDI,TOF,perfringens,分离株,标准菌株,MBT,Compass,软件鉴定,鉴定分析,蛋白质指纹图谱,Explorer,立命,自建数据库,采用标准,原自,自带,菌株鉴定,污染来源,污染源,细菌数,鉴定能力
AB值:
0.234663
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