典型文献
甜菜NAC基因家族生物信息学分析
文献摘要：
NAC转录因子家族是植物特有的一类重要转录因子,广泛参与植物生长、发育以及器官的建成、逆境胁迫应答等过程.为进一步研究甜菜(Beta vulgris L.)NAC转录因子家族,本研究利用生物信息学方法对甜菜NAC基因所编码的蛋白理化性质、二级结构、保守基序、亚细胞定位、系统进化关系进行了分析.结果显示,甜菜NAC转录因子序列的鉴定出52个甜菜NAC基因,不均匀的分布于9条染色体上,6号染色体上分布最多,为11个;其次是1号染色体,为10个;7号染色体分布最少,只有1个.有1个NAC转录因子成员(BvNAC30)的核苷酸序列具有miR164靶序列识别位点.甜菜NAC转录因子的进化树分析结果显示,BvNAC蛋白序列可分为18个亚族.各亚族成员数量分布差异很大,其中Ⅻ亚族的Bv NAC转录因子成员最多为28个,而Ⅸ和Ⅹ亚族成员均只有一个.其中的Ⅻ亚族与拟南芥并没有相聚成簇,甜菜NAC转录因子的NAC保守结构域是高度保守的.NAC保守结构域中包含15个亚结构域,甜菜NAC转录因子Ⅰ、Ⅴ、Ⅺ亚族成员的保守性最高,而Ⅻ亚族成员保守性最低.本研究将为甜菜NAC基因家族的进一步功能分析奠定重要的研究基础.
文献关键词：
甜菜;NAC基因家族;生信分析
中图分类号：
作者姓名：
周珂;刘乃新;于清涛
作者机构：
黑龙江大学现代农业与生态环境学院,哈尔滨150080;哈尔滨市农业科学院,哈尔滨150000
文献出处：
引用格式：
[1]周珂;刘乃新;于清涛-.甜菜NAC基因家族生物信息学分析)[J].中国甜菜糖业,2022(02):1-7
A类：
vulgris,BvNAC30,BvNAC
B类：
甜菜,基因家族,生物信息学分析,植物生长,逆境胁迫应答,Beta,研究利用,利用生物,生物信息学方法,二级结构,保守基序,亚细胞定位,系统进化,进化关系,子序列,miR164,靶序列,序列识别,进化树分析,成员数,数量分布,分布差异,拟南芥,相聚,保守结构域,亚结构,保守性,功能分析,生信分析
AB值：
0.262196
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