典型文献
甜菜组蛋白乙酰转移酶(HAT)超家族成员的鉴定与表达模式分析
文献摘要：
组蛋白乙酰转移酶(Histone acetyltransferase,HAT)催化的组蛋白乙酰化修饰能够通过改变染色质结构调控植物的生长发育和胁迫应答.但是,关于甜菜HAT家族成员的信息及其参与非生物胁迫应答的情况尚未有明确报道.本研究利用生物信息学方法对甜菜HAT基因家族进行系统进化、基因结构、功能结构域、非生物胁迫下基因表达模式进行分析.研究结果表明,甜菜共有7个HAT家族成员,分别归属于GNAT、TAFII250和CBP家族.7个HAT成员分别分布在5条染色体上;编码长度为461～1904 aa氨基酸.甜菜组蛋白乙酰转移酶(BvHATs)除含有Acetyltransf_1、Acetyltransf_10和HAT_KAT11保守结构域外,还含有zf-TAZ、ZZ、PHD等多种功能结构域,并且不同成员间功能结构域差异较大.基于转录组测序结果,发现在不同非生物胁迫下的BvHATs基因水平发生显著变化.其中Bv4_085980_ujsz在盐胁迫和碱胁迫下都发生显著变化,而Bv2_026300_ydyh在冷胁迫下有明显下调.BvHATs家族基因参与非生物胁迫应答,但系统进化和表达模式分析表明BvHATs参与的调控通路可能不同于拟南芥.本研究为今后阐明BvHATs的基因功能提供了必要信息.
文献关键词：
甜菜;组蛋白乙酰转移酶;基因家族;非生物胁迫;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
蒋依辰;王琳玉;于清洋;邳植
作者机构：
黑龙江大学现代农业与生态环境学院,哈尔滨150080
文献出处：
引用格式：
[1]蒋依辰;王琳玉;于清洋;邳植-.甜菜组蛋白乙酰转移酶(HAT)超家族成员的鉴定与表达模式分析)[J].中国糖料,2022(02):1-7
A类：
TAFII250,BvHATs,Acetyltransf,KAT11,Bv4,ujsz,Bv2,ydyh
B类：
甜菜,组蛋白乙酰转移酶,超家族,表达模式分析,Histone,acetyltransferase,组蛋白乙酰化,乙酰化修饰,染色质结构,结构调控,胁迫应答,非生物胁迫,研究利用,利用生物,生物信息学方法,基因家族,系统进化,基因结构,功能结构,基因表达模式,归属于,GNAT,CBP,码长,aa,保守结构域,域外,zf,TAZ,ZZ,PHD,多种功能,转录组测序,基因水平,盐胁迫,碱胁迫,冷胁迫,家族基因,调控通路,拟南芥,基因功能
AB值：
0.279423
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
