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典型文献
琅琊鸡胚MSX2基因克隆及发育性表达变化
文献摘要:
[目的]克隆鸡Msh同源框2(Msh-homeobox2,MSX2)基因,并对其进行生物信息学和胚胎期表达模式分析,为进一步研究MSX2基因的结构和功能提供支持.[方法]对80枚琅琊鸡种蛋进行孵化,分别于孵化期第1、2、3、4、5、6、9、12、15、18天采集样品(1~6胚龄采集整胚,9、12、15、18胚龄分别采集心脏和肝脏),提取总RNA,利用RT-PCR方法扩增并克隆MSX2基因,对其进行生物信息学分析;利用实时荧光定量PCR技术分析MSX2基因在琅琊鸡鸡胚和组织中的表达水平.[结果]成功克隆了琅琊鸡胚MSX2基因,序列长度为818 bp,开放阅读框为780 bp,编码259个氨基酸.琅琊鸡MSX2氨基酸序列与日本鹌鹑、秃鹰和仓鸮的相似性最高,均为99.23%,与山羊的相似性最低,为74.54%;系统进化树分析结果显示,琅琊鸡与日本鹌鹑聚为一类.生物信息学分析表明,MSX2蛋白分子质量为28 235.18 u,等电点(pI)为9.71,没有信号肽和跨膜域,为不稳定的亲水性蛋白,主要分布在细胞核(60.9%);存在37个磷酸化位点、8个O-糖基化位点和1个N-糖基化位点;二级结构主要由无规则卷曲(63.32%)和α-螺旋(28.19%)组成.实时荧光定量PCR分析表明,MSX2基因在整胚(1~6胚龄)中的表达水平呈现先上升后下降趋势,且在4胚龄时表达水平最高,极显著高于1、2、3胚龄(P<0.01);MSX2基因在12胚龄鸡心脏中的表达水平极显著低于9胚龄(P<0.01);在9~18胚龄鸡肝脏中的表达量呈逐渐下降趋势,且在9胚龄鸡肝脏中表达水平最高(P<0.05).[结论]试验成功克隆了琅琊鸡MSX2基因序列,其表达模式在不同胚龄和同一胚龄不同组织间存在差异,为进一步探索琅琊鸡MSX2基因的结构和功能奠定了基础.
文献关键词:
琅琊鸡;MSX2基因;表达;生物信息学
作者姓名:
逄淯婷;张渝洁;唐玮琦;王岩;邢晋祎
作者机构:
临沂大学生命科学学院,临沂276005;四川农业大学动物科技学院,成都611130
文献出处:
引用格式:
[1]逄淯婷;张渝洁;唐玮琦;王岩;邢晋祎-.琅琊鸡胚MSX2基因克隆及发育性表达变化)[J].中国畜牧兽医,2022(05):1641-1650
A类:
琅琊鸡,Msh,homeobox2
B类:
鸡胚,MSX2,基因克隆,发育性,表达变化,胚胎期,表达模式分析,结构和功能,种蛋,孵化期,生物信息学分析,鸡鸡,bp,开放阅读框,氨基酸序列,日本鹌鹑,秃鹰,山羊,系统进化树分析,分子质量,等电点,pI,信号肽,跨膜域,亲水性,细胞核,磷酸化,糖基化位点,二级结构,无规则,卷曲,先上,鸡心,鸡肝,基因序列,同胚,不同组织
AB值:
0.231155
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