典型文献
玉米核不育基因MS22克隆及其同源基因生物信息学分析
文献摘要:
利用水稻ROXY1、ROXY2基因序列,在玉米基因组数据库进行同源检索,发现GRMZM2G442791基因(MS22)序列与ROXY1、ROXY2之间具有较高的相似度(73%~79%).以玉米B73自交系为实验材料克隆MS22启动子区序列;用生物信息学方法对水稻ROXY1、ROXY2及MS22基因核苷酸序列以及蛋白质结构、亲水性和疏水性及进化树等进行分析.结果表明,玉米雄性核不育相关基因MS22编码区长度为480 bp,编码159个氨基酸;ROY1编码区长度为408 bp,编码136个氨基酸;ROXY2编码区长度为420 bp,编码140个氨基酸.通过对蛋白功能结构域进行分析发现,MS22、ROXY1、ROXY2都为谷氧还蛋白家族成员,具有GRX家族基因相似的功能结构域和近似的三级结构.因此推测,MS22可能与ROXY1、ROXY2具有相似的功能,可能参与氧化还原调节、植物胁迫防御,在控制雄性配子发生中起主要调控作用.
文献关键词:
玉米;雄性不育;MS22基因;生物信息
中图分类号:
作者姓名:
高永钢
作者机构:
内蒙古科技大学 内蒙古包头 014010;内蒙古科技大学能源与环境学院 内蒙古包头 014010
文献出处:
引用格式:
[1]高永钢-.玉米核不育基因MS22克隆及其同源基因生物信息学分析)[J].热带农业科学,2022(03):45-50
A类:
MS22,ROXY1,ROXY2,GRMZM2G442791,ROY1,GRX
B类:
不育基因,同源基因,生物信息学分析,水稻,基因序列,基因组数据,行同,B73,自交系,实验材料,启动子区,生物信息学方法,蛋白质结构,亲水性,疏水性,进化树,雄性核不育,编码区,区长,bp,蛋白功能,功能结构,结构域,谷氧还蛋白,白家,家族基因,三级结构,氧化还原调节,植物胁迫,胁迫防御,配子发生,雄性不育
AB值:
0.269071
相似文献
机标中图分类号,由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成,仅供学习研究参考。