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马立克病病毒pUL56蛋白对DF-1细胞免疫通路相关基因的转录调控研究
文献摘要：
马立克病病毒(Marek's disease virus,MDV)UL56基因编码α-疱疹病毒同源蛋白pUL56.为全面了解该病毒蛋白与宿主细胞的互作关系,本研究首先将表达红色荧光蛋白标记的MDV pUL56质粒转染鸡DF-1细胞系,瞬时表达蛋白的细胞经流式细胞术分选,富集阳性细胞群进行高通量测序及mRNA转录组分析.测序结果显示,表达pUL56的DF-1细胞存在914个差异表达基因,其中462个上调,452个下调.通过GO、KEGG和Reactome通路富集分析,发现富集的显著差异表达基因分布于先天性免疫反应、细胞因子产生等相关信号通路.在此基础上,随机选取了 Ⅰ型干扰素信号通路和促炎症细胞因子基因进行RT-qPCR验证,IFI6、IFIH1、CD83、HSP90AAl、IL-1β和IL-8L1基因的表达量均为上调,而IL-12β表达则下调,该结果与高通量测序相符.本研究提示pUL56作为非结构蛋白,可能对宿主细胞过程有广泛的调节作用.
文献关键词：
马立克病病毒;pUL56;转录组;信号通路;差异表达基因
中图分类号：
作者姓名：
张金城;马德青;徐贝贝;冯伟民;陈鑫;韦天超;韦平;黄腾
作者机构：
广西大学动物科学技术学院,南宁530004
文献出处：
引用格式：
[1]张金城;马德青;徐贝贝;冯伟民;陈鑫;韦天超;韦平;黄腾-.马立克病病毒pUL56蛋白对DF-1细胞免疫通路相关基因的转录调控研究)[J].病毒学报,2022(03):684-693
A类：
pUL56,Marek,HSP90AAl,8L1
B类：
马立克病病毒,DF,细胞免疫,转录调控,调控研究,disease,virus,MDV,基因编码,疱疹病毒,同源蛋白,病毒蛋白,宿主,主细胞,互作关系,红色荧光蛋白,质粒转染,细胞系,瞬时表达,流式细胞术,分选,阳性细胞,转录组分析,差异表达基因,Reactome,通路富集分析,基因分布,先天性免疫反应,干扰素信号通路,促炎,炎症细胞因子,qPCR,IFI6,IFIH1,CD83,非结构蛋白
AB值：
0.281054
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