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典型文献
基于网络药理学及分子对接技术探讨绞股蓝防治肥胖的作用机制
文献摘要:
目的:通过网络药理学及分子对接技术揭示绞股蓝防治肥胖的物质基础及潜在作用机制.方法:使用TCMSP数据库结合文献补充筛选绞股蓝活性成分;使用Pubchem、Swiss target prediction数据库收集绞股蓝活性成分作用靶点;使用GeneCards、OMIM、DurgBank数据库荻取肥胖疾病靶点.取绞股蓝作用靶点与疾病靶点交集为绞股蓝防治肥胖作用靶点,并使用Cytoscape3.7.2软件构建药物-化合物-靶点网络;使用STRING数据库构建靶蛋白互作PPI网络筛选核心靶点,Discovery Studio 3.5对筛选出的核心靶点与活性成分分子对接,DAVID数据库对交集靶点进行GO富集和KEGG通路注释分析,通过上述结果构建成分-靶点-通路相互作用网络模型.结果:共筛选出槲皮素、3-甲基鼠李素、人参皂苷f2、绞股蓝皂苷XXVIII等16个化合物为绞股蓝防治肥胖物质基础,107个绞股蓝治疗肥胖靶点,其中包括STAT3、AKT1、VEGFA、SRC、EGFR、MAPK3等38个关键靶点;分子对接结果显示,PPI中度值前6位核心靶点与相对应化合物3-甲基柔二醇、3-甲基鼠李素、黄夹次甙丙、a-菠菜甾醇、胆甾醇、槲皮素、人参皂苷f2、绞股蓝皂苷XXVIII有较好的结合活性,推测这些化合物可能为主要药效成分;GO分析得绞股蓝防治肥胖主要涉及细胞生长增殖过程、代谢过程等生物过程,酶结合、蛋白结合等分子功能,细胞核、细胞质等细胞组成.KEGG通路富集结果显示,绞股蓝防治肥胖通路涉及癌症信号通路、癌症中的蛋白多糖通路、PI3K-Akt信号通路、HIF-1信号通路等.结论:本研究初步揭示了绞股蓝可通过多成分、多靶点、多通路影响机体脂肪细胞增殖分化、糖脂代谢及维持机体稳态等多方面实现肥胖防治作用,为进一步研究其有效成分及分子机制提供依据.
文献关键词:
肥胖;绞股蓝;网络药理学;分子对接;作用机制
作者姓名:
苏瑶;王兰;常相娜;龚频;杨文娟;崔丹丹
作者机构:
陕西科技大学食品与生物工程学院,陕西西安710021
文献出处:
引用格式:
[1]苏瑶;王兰;常相娜;龚频;杨文娟;崔丹丹-.基于网络药理学及分子对接技术探讨绞股蓝防治肥胖的作用机制)[J].食品工业科技,2022(04):12-23
A类:
DurgBank,XXVIII
B类:
网络药理学,分子对接技术,技术探讨,潜在作用,TCMSP,活性成分,Pubchem,Swiss,target,prediction,成分作用,作用靶点,GeneCards,OMIM,点交,集为,Cytoscape3,软件构建,靶点网络,STRING,数据库构建,靶蛋白,蛋白互作,PPI,核心靶点,Discovery,Studio,DAVID,交集靶点,相互作用网络,槲皮素,人参皂苷,f2,绞股蓝皂苷,个化,STAT3,AKT1,VEGFA,SRC,EGFR,MAPK3,关键靶点,菠菜,胆甾醇,结合活性,药效成分,细胞生长,代谢过程,生物过程,蛋白结合,细胞核,细胞质,细胞组成,通路富集,集结,蛋白多糖通路,PI3K,Akt,HIF,多成分,多靶点,多通路,体脂肪,脂肪细胞增殖分化,糖脂代谢,防治作用,有效成分
AB值:
0.339645
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