典型文献
'德钦'紫花苜蓿叶绿体基因组序列及特征分析
文献摘要：
'德钦'紫花苜蓿(Medicago sativa L.'Deqin',以下简称'德钦'苜蓿)是一种优良的地方品种,具有特异耐旱性、耐热性和耐酸铝性.本研究利用Illumina第二代高通量测序技术对其叶绿体全基因组进行测序(NCBI登录号:MN218692),并对其结构及特征进行分析.结果显示:'德钦'苜蓿叶绿体基因组含有一个反向重复区,属于IR缺失型;总长为125 470 bp,共有110个基因,其中蛋白质编码基因76个、tRNA 30个和rRNA 4个,缺失3个基因(rpsl6,rpl22和infA),总GC含量为33.9％;相对同义密码子使用度显示,'德钦'苜蓿70.74％的密码子使用度＞1,偏好以A和T结尾;共鉴定出115个SSRs位点,其中clpP基因鉴定出与紫花苜蓿不同SSRs位点;最大似然树结果显示'德钦'苜蓿与紫花苜蓿聚在一起,支持率为75％.研究结果将对苜蓿属叶绿体基因组工程研究及'德钦'苜蓿特异基因的进一步鉴定利用提供一定的参考价值.
文献关键词：
’德钦’紫花苜蓿;叶绿体基因组;高通量测序;特征分析;系统发育分析
中图分类号：
作者姓名：
孙志轩;敖平星;毕玉芬;赵雁
作者机构：
云南农业大学园林园艺学院,云南昆明650201;云南农业大学动物科学技术学院,云南昆明650201
文献出处：
引用格式：
[1]孙志轩;敖平星;毕玉芬;赵雁-.'德钦'紫花苜蓿叶绿体基因组序列及特征分析)[J].草地学报,2022(02):320-328
A类：
Deqin,耐酸铝,MN218692,rpsl6,infA
B类：
德钦,紫花苜蓿,叶绿体基因组,基因组序列,Medicago,sativa,地方品种,耐旱性,耐热性,研究利用,Illumina,第二代高通量测序,高通量测序技术,叶绿体全基因组,NCBI,登录号,重复区,总长,bp,蛋白质编码基因,tRNA,rRNA,rpl22,相对同义密码子使用度,结尾,SSRs,clpP,基因鉴定,最大似然,聚在一起,支持率,苜蓿属,组工,工程研究,异基因,系统发育分析
AB值：
0.293133
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