典型文献
柳叶芹叶绿体基因组组装与序列特征
文献摘要:
以2020年5月31日采自黑龙江省伊春市的柳叶芹(Czernaevia laevigata turcz.)为试验材料,利用十六烷基三甲基溴化铵法(CTAB)提取基因组DNA,采用Illumina NovaSeq平台进行高通量测序,得到柳叶芹完整的叶绿体基因组序列,分析柳叶芹叶绿体基因组组装、序列特征、系统发育.结果表明:柳叶芹叶绿体基因组总长度146161 bp,包括1个大单拷贝区长度为93538 bp、1个小单拷贝区长度为17779 bp,由2个反向重复序列分别分隔,每个反向重复序列为17422 bp.对柳叶芹叶绿体全基因组共鉴定出133个基因.系统发育分析表明,柳叶芹与疏叶当归有密切的亲缘关系.柳叶芹的叶绿体基因组序列,为研究伞形科其他植物提供了较为详细、完善的资料,为该物种鉴定以及群体和个体水平的遗传差异分析提供了新的方法.
文献关键词:
柳叶芹;叶绿体基因组;系统发育;伞形科
中图分类号:
作者姓名:
闫嵩;柳驰;任伟超;刘秀波;徐姣;马伟
作者机构:
黑龙江中医药大学,哈尔滨,150040;开姆尼茨工业大学,德国·开姆尼茨;黑龙江中医药大学
文献出处:
引用格式:
[1]闫嵩;柳驰;任伟超;刘秀波;徐姣;马伟-.柳叶芹叶绿体基因组组装与序列特征)[J].东北林业大学学报,2022(02):49-52,99
A类:
柳叶芹,Czernaevia,turcz
B类:
叶绿体基因组,基因组组装,序列特征,黑龙江省,伊春市,laevigata,十六烷基三甲基溴化铵,CTAB,Illumina,NovaSeq,基因组序列,总长度,bp,拷贝,区长,重复序列,分隔,叶绿体全基因组,系统发育分析,当归,亲缘关系,伞形科,物种鉴定,遗传差异
AB值:
0.221831
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