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典型文献
3种榕属叶绿体基因组密码子偏好性分析
文献摘要:
为更好了解黄葛榕、榕树和异叶榕叶绿体基因组密码子的使用模式,利用Codon W、CUSP、EXCEL等软件对其叶绿体编码基因的密码子使用偏好性进行系统分析.结果表明,3种榕属植物的第3位碱基以A/T为主且GC3的含量远低于GC1和GC2;并且大部分的ENC值都在40以上,说明3种榕属植物的密码子偏好性较弱;中性绘图、ENC-plot和PR2-plot绘图分析表明,3种榕属植物的密码子偏好性不仅受选择的影响,还受突变等多重因素的影响;此外,还确定了 3种榕属植物的最优密码子,且都以A/U结尾.该研究结果可为榕属植物叶绿体基因组后续的外源基因改良奠定基础.
文献关键词:
黄葛榕;榕树;异叶榕;叶绿体基因组;最优密码子
作者姓名:
夏晞;彭劲谕;王大玮;张新洛;李江飞
作者机构:
西南林业大学,西南山地森林资源保育与利用教育部重点实验室/云南省高校林木遗传改良与繁育重点实验室,云南昆明650224
文献出处:
引用格式:
[1]夏晞;彭劲谕;王大玮;张新洛;李江飞-.3种榕属叶绿体基因组密码子偏好性分析)[J].西北林学院学报,2022(05):88-94
A类:
异叶榕
B类:
叶绿体基因组,密码子偏好性,偏好性分析,黄葛榕,榕树,使用模式,Codon,CUSP,EXCEL,编码基因,密码子使用偏好性,榕属植物,碱基,GC3,GC1,GC2,ENC,绘图,plot,PR2,多重因素,最优密码子,结尾,植物叶,外源基因
AB值:
0.287557
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