典型文献
菊苣的基因组大小估算及基因组调查测序
文献摘要：
菊苣(Cichoriumintybus L.)是一种多年生、药食同源的植物,既可作为蔬菜种植,也可作为优质牧草推广应用.本研究对'将军'(K042)这一具有较高饲用价值的菊苣牧草品种展开物种鉴定、染色体计数、基因组大小估算、调查测序及初步组装研究.系统进化分析表明,K042跟生菜的亲缘关系较近.染色体计数结果显示,K042体细胞有18条染色体(2n=18);流式细胞术实验结果显示,K042的基因组大小约为1170.00 Mb;二代Illumina HiSeq测序分析进一步估算K042基因组大小约为1424.00 Mb.K042基因组的杂合率为1.12％,重复序列含量为73.56％.K042基因组具有高重复、高杂合的复杂特征.根据基因组测序结果对K042展开基因组组装工作,组装后基因组大小为823.36 Mb,重叠群N50长度约为1.03 kb,本研究结果可为将来菊苣分子生物学和遗传育种研究提供重要的基因组学基础参考数据.
文献关键词：
菊苣(Cichoriumintybus L.);全基因组测序;流式细胞术;K-mer分析
中图分类号：
作者姓名：
费星宇;赵泓;杜洋;段梦琪;王晨晨;张彬;刘雪;李大勇;许立新
作者机构：
北京林业大学草业与草原学院,北京 100083;北京市农林科学院蔬菜研究所,北京 100083;山东师范大学生命科学学院,山东 济南 250014
文献出处：
引用格式：
[1]费星宇;赵泓;杜洋;段梦琪;王晨晨;张彬;刘雪;李大勇;许立新-.菊苣的基因组大小估算及基因组调查测序)[J].草地学报,2022(12):3207-3214
A类：
Cichoriumintybus,K042
B类：
菊苣,基因组大小,基因组调查,多年生,药食同源,蔬菜种植,优质牧草,将军,一具,饲用价值,开物,物种鉴定,系统进化分析,生菜,亲缘关系,体细胞,2n,流式细胞术,Mb,Illumina,HiSeq,测序分析,杂合率,重复序列,复杂特征,基因组组装,装工,后基因组,重叠群,N50,kb,分子生物学,遗传育种,育种研究,基因组学,全基因组测序,mer
AB值：
0.344662
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
