典型文献
虫草属线粒体基因组特征及系统发育
文献摘要:
[目的]很多虫草属(Cordyceps)物种含有丰富的虫草素、多糖、喷司他丁等有效成分,具有重要的医疗保健功效和开发利用价值.研究虫草属线粒体基因组特征及系统发育,为虫草科真菌物种的起源与进化、资源保护和开发利用提供借鉴.[方法]基于9种虫草菌线粒体基因组序列,利用MEGA、REPuter、MISA、mVISTA和PAML等生物信息学软件,对线粒体基因组特征、序列重复、结构变异、基因进化和系统发育进行分析.[结果]虫草属物种线粒体基因组大小差异明显,均含有15个蛋白编码基因、2个rRNA和至少25个tRNA;物种重复序列数目差异较大,多为正向重复和回文重复,SSR主要为二核苷酸、三核苷酸和四核苷酸重复,且含有较高比例的A或T碱基;线粒体基因组结构高度相似,未发现基因重排现象,线粒体基因组大小和内含子长度呈线性正相关;基因rps3核苷酸变异程度较高,所有基因的dN/dS比率均小于1,nad4、rps3、cob、nad2和cox1等基因存在正选择位点;粗糙虫草和粉质虫草聚类关系较近,而细脚虫草、蝉棒束孢和蝉花虫草聚在一起.[结论]虫草属物种线粒体基因组结构保守,基因组大小主要受内含子影响,蛋白编码基因主要受纯化选择作用,部分基因在与宿主和环境互作过程中受到了轻微的选择作用.
文献关键词:
虫草属;线粒体基因组;进化;变异
中图分类号:
作者姓名:
韩利红;柯欣茹;秦相月;普琪;任怡园;刘潮
作者机构:
曲靖师范学院生物资源与食品工程学院/云南省高校特色果酒技术创新与应用工程研究中心,云南曲靖 655011
文献出处:
引用格式:
[1]韩利红;柯欣茹;秦相月;普琪;任怡园;刘潮-.虫草属线粒体基因组特征及系统发育)[J].西南农业学报,2022(07):1520-1528
A类:
喷司他丁,细脚虫草,蝉棒束孢
B类:
虫草属,线粒体基因组,基因组特征,系统发育,Cordyceps,虫草素,有效成分,医疗保健,保健功效,开发利用价值,虫草科,菌物,资源保护,保护和开发,草菌,基因组序列,MEGA,REPuter,MISA,mVISTA,PAML,生物信息学软件,结构变异,基因进化,基因组大小,小差,蛋白编码,编码基因,rRNA,tRNA,重复序列,回文,SSR,高比例,碱基,基因组结构,基因重排,内含子,子长,rps3,dN,dS,nad4,cob,nad2,cox1,正选择,选择位点,聚类关系,蝉花,花虫,聚在一起,选择作用,宿主,互作过程
AB值:
0.392952
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