典型文献
蛋鸡资源群体的小肠质量全基因组关联分析
文献摘要:
小肠是鸡重要的营养消化吸收器官,在蛋鸡生长和生产发挥重要作用,小肠质量是反映肠道发育情况的重要生理指标,有必要对其遗传结构进行研究.利用白来航鸡与东乡绿壳蛋鸡杂交构建F2代资源群体,采用600K鸡SNP芯片对F2代1512羽个体进行基因型检测,通过PLINK软件对小肠质量性状进行全基因组关联分析(GWAS).结果显示,十二指肠、空肠和回肠的遗传力分别为0.32、0.28、0.26,说明小肠质量表现出中等遗传力水平.GWAS共鉴定出185、201、36个SNP分别与十二指肠、空肠、回肠质量显著相关(共422个SNP),其中,421个SPN位于1号染色体166.6~173.2 Mb区域,说明该区域与小肠质量关系密切.共有28个SNP与3段小肠质量均显著相关,其中,6个SNP位于对应4个候选基因(FOXO1、CKAP2、CAB39L和MRPS31)的内含子区,它们可能与小肠质量密切相关.通过GWAS分析,初步筛选出与蛋鸡小肠质量性状相关的6个SNP和4个候选基因,可为性状的遗传机制解析和分子育种提供理论依据.
文献关键词:
蛋鸡;小肠质量;GWAS;遗传结构
中图分类号:
作者姓名:
李永峰;王克华;窦套存;胡玉萍;郭军;王星果;马猛;曲亮
作者机构:
江苏省家禽科学研究所,江苏扬州225125
文献出处:
引用格式:
[1]李永峰;王克华;窦套存;胡玉萍;郭军;王星果;马猛;曲亮-.蛋鸡资源群体的小肠质量全基因组关联分析)[J].江苏农业科学,2022(22):165-170
A类:
小肠质量,CAB39L,MRPS31
B类:
全基因组关联分析,消化吸收,吸收器,肠道发育,发育情况,生理指标,遗传结构,白来航鸡,东乡绿壳蛋鸡,鸡杂,F2,600K,SNP,基因型,PLINK,质量性状,GWAS,十二指肠,空肠,回肠,遗传力,SPN,Mb,质量关系,候选基因,FOXO1,CKAP2,内含子,子区,初步筛选,遗传机制,机制解析,分子育种
AB值:
0.309521
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