典型文献
团头鲂基因组微卫星特征及SSR位点开发
文献摘要：
为充分挖掘和利用团头鲂种质资源,有效开展品种间遗传多样性分析及分子育种工作,利用生物信息学方法分析团头鲂基因组数据,共检测序列18 243条,其中,含有SSR位点的序列为3 940条,占总检测序列条数的21.60％,检测出SSR位点共350 898个,平均约3.1 kb出现1个SSR位点.其中,二核苷酸重复的位点最多,占总SSR位点的67.43％;三核苷酸、四核苷酸、五核苷酸和六核苷酸重复分别占14.68％、14.83％、2.89％和0.16％.350 898个SSR位点中共有257种重复基序,二核苷酸、三核苷酸、四核苷酸、五核苷酸和六核苷酸重复基序类型占比最高的分别为 AT/AT(29.46％)、AAT/ATT(8.56％)、AGAT/ATCT(4.57％)、AATAT/ATATT(0.97％)和 AACCCT/AGGGTT(0.06％).设计合成288对SSR荧光引物,有149对引物能够稳定扩增出与预期产物一致的条带,93对引物表现出多态性.综上所述,该研究发掘团头鲂基因组SSR位点,设计和合成SSR引物,验证其多态性,为团头鲂分子指纹图谱构建、种质资源的创新利用奠定了基础.
文献关键词：
团头鲂;基因组;SSR;多态性;种质资源;遗传多样性;分子育种
中图分类号：
作者姓名：
张芹;王延晖;王冰柯;屈长义
作者机构：
河南省水产科学研究院,河南郑州450044
文献出处：
引用格式：
[1]张芹;王延晖;王冰柯;屈长义-.团头鲂基因组微卫星特征及SSR位点开发)[J].江苏农业科学,2022(03):79-85
A类：
AATAT,ATATT,AACCCT,AGGGTT
B类：
团头鲂,微卫星,SSR,种质资源,展品,种间,遗传多样性分析,分子育种,育种工作,利用生物,生物信息学方法,基因组数据,条数,kb,六核,复分,点中,基序,AGAT,ATCT,设计合成,引物,条带,多态性,综上所述,分子指纹,指纹图谱,图谱构建,创新利用
AB值：
0.269381
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
